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par Claire Bissery
12 Sep 2012, 08:07
Forum : Questions en cours
Sujet : Optimisation du temps de calcul d’un fonction de bootstrap
Réponses : 6
Vues : 2174

Merci pour toutes vos réponses. Je vais essayer d’intégrer le package boot en modifiant les fonctions déjà programmés. Si cela implique trop de restructuration, je verrai pour retirer la liste et mettre un array à la place, en espérant que le merge ne prenne pas trop de temps. Bonne journée Claire
par Claire Bissery
10 Sep 2012, 15:50
Forum : Questions en cours
Sujet : Optimisation du temps de calcul d’un fonction de bootstrap
Réponses : 6
Vues : 2174

Optimisation du temps de calcul d’un fonction de bootstrap

Bonjour, Je travaille sur une plateforme de calcul et d’analyse codée en R avec une interface tcltk (projet PAMPA). J’ai besoin d’optimiser le temps de calcul de mes fonctions de bootstrap. Pour l’instant cela a été codé sans utiliser la fonction boot avec une boucle contenant un sample, quelques fo...
par Claire Bissery
09 Jan 2007, 12:34
Forum : Archives : Fonctions statistiques
Sujet : Critère agrégation pour CAH
Réponses : 1
Vues : 7378

Bonjour, pour la fonction agnes() du package cluster les critères d'agregation se definissent avec l'argument method (voir fiche d'aide) la méthode "single" (single linkage) correspond au lien simple la methode "complete" (complete linkage) correspond au lien maximal si vous voul...
par Claire Bissery
09 Jan 2007, 10:20
Forum : Questions en cours
Sujet : standardised major axis
Réponses : 2
Vues : 3997

Bonjour, Merci pour votre réponse. J’ai deja lu l’article de Warton, D.I. et al. (2006) Bivariate line-fitting methods for allometry, ainsi que le Biometry de Sokal et Rohlf, et pas mal d’autres articles et livres de référence sur le sujet. Les deux méthodes présentent bien des tests différents et d...
par Claire Bissery
08 Jan 2007, 10:32
Forum : Questions en cours
Sujet : standardised major axis
Réponses : 2
Vues : 3997

standardised major axis

Bonjour, Je recherche quelqu’un ayant utilisé le package smatr (Standardised Major Axis Estimation and Testing Routines) de David Warton. J’étudie la relation allometrique entre la section d’une branche et la biomasse soutenue par cette branche pour différentes variétés de manguiers. J’ai d’abord ét...
par Claire Bissery
18 Aoû 2006, 09:57
Forum : Archives : Fonctions statistiques
Sujet : dummy.coef
Réponses : 5
Vues : 10975

Bonjour, Merci pour votre réponse, cela fonctionne en effet lorsque les variables sont définies au préalable. Je me pose une question toujours par rapport aux coefficients des modalités d’un facteur en analyse de covariance et de variance. Les coefficients peuvent être retrouvés en tenant compte des...
par Claire Bissery
17 Aoû 2006, 12:56
Forum : Archives : Fonctions statistiques
Sujet : dummy.coef
Réponses : 5
Vues : 10975

Des données sont toujours disponible à cette adresse: ftp://ftp.cirad.fr/pub/group-r/groupe-r/Data/allometrie.txt J'utilise les contrasts "contr.sum" Sur ce jeu de données on peut regarder le modèle suivant : lm1<-lm(log(mstoter)~log(dbm)+variete) Je n’étudie pas ce modèle en raison du dés...
par Claire Bissery
17 Aoû 2006, 10:50
Forum : Archives : Fonctions statistiques
Sujet : dummy.coef
Réponses : 5
Vues : 10975

dummy.coef

Bonjour, Je réalise des analyses de covariance avec la fonction lm(). Pour recupérer les coefficients j'utilise les fonctions coef() et dummy.coef(). La fonction dummy.coef me donne automatiquement 0 comme valeur de pente alors que mes pentes sont non nulles (verifié avec coef()). Je ne sais pas si ...
par Claire Bissery
20 Juin 2006, 06:29
Forum : Archives : Fonctions statistiques
Sujet : modèle mixte
Réponses : 5
Vues : 23965

Je peux réaliser mon étude en considérant la variété comme un effet fixe, mais j’aimerai prendre en compte un effet aléatoire de la variété pour plusieurs raisons. Premièrement j’aimerai voir si la variété a un effet aléatoire sur la relation allometrique générale entre le diamètre et la biomasse. E...
par Claire Bissery
19 Juin 2006, 12:54
Forum : Archives : Fonctions statistiques
Sujet : modèle mixte
Réponses : 5
Vues : 23965

Merci pour votre réponse Je veux regarder l’effet aléatoire de la variété sur la relation entre le diamètre et la biomasse. Je recherche le modèle le plus adapté aux données (pente et intercept aléatoire, pente aléatoire, pas d’effet aléatoire de la variété). Seulement, je ne comprend pas pourquoi l...
par Claire Bissery
19 Juin 2006, 09:56
Forum : Archives : Fonctions statistiques
Sujet : modèle mixte
Réponses : 5
Vues : 23965

modèle mixte

Bonjour, J’ai quelques problèmes avec la fonction lme sous R et sous Splus. J’étudie la relation allométrique entre le diamètre des branches et la biomasse soutenue par ces branches chez le manguier. Je voudrais regarder l’influence de la variété sur la relation entre le diamètre et la biomasse. J’a...

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