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par David Robelin
01 Juil 2010, 08:09
Forum : Questions en cours
Sujet : utilisation des vecteurs d'indice
Réponses : 10
Vues : 5490

Si j'ai bien suivi, seule la variable TOT0 est utile pour l'exemple. Voilà une proposition de code, avec un mini-exemple de données (4 individus, 2 pères, 2 mères) #Lecture des donnees exemples toto = read.table(textConnection(" famille ind sexe pere mere survie [1,] 513 1 2 6 8 0 [2,] ...
par David Robelin
29 Juin 2010, 14:56
Forum : Questions en cours
Sujet : utilisation des vecteurs d'indice
Réponses : 10
Vues : 5490

Bonjour, Peut-être qu'il vaut mieux éviter de passer par les deux variables : EBV0pere et EBV0mere (j'imagine que tu utilise la fonction 'ranef') Par exemple : EBV0 <- ranef(lm0) EBVcan <- EBV0[pedi1[,4],"pere"] + EBV0[pedi1[,5],"mere"] Pas facile de tester sans un exempl...
par David Robelin
31 Mar 2010, 12:06
Forum : Questions en cours
Sujet : "Downgrade" de version de R
Réponses : 1
Vues : 1938

L'auteur de Rpad m'a donné une petite modification à effectuer pour que le package fonctionne sur la version 2.10 de R. Le problème est résolu sans diminuer la version de R.
Au passage : l'auteur de Rpad a annoncé qu'il ne pouvait plus maintenir le package.
par David Robelin
31 Mar 2010, 09:26
Forum : Questions en cours
Sujet : "Downgrade" de version de R
Réponses : 1
Vues : 1938

"Downgrade" de version de R

Bonjour, Je viens de mettre à jour les packages installés, à l'aide de la commande update.packages(). Tout s'est bien passé, ca a eu comme conséquence de mettre à jour également le "package" base, et je dispose maintenant de la dernière version de R (2.10.1). Or, il s'avère que le paquet &...
par David Robelin
24 Mar 2010, 08:51
Forum : Questions en cours
Sujet : utilisation des vecteurs d'indice
Réponses : 10
Vues : 5490

Bonjour, Je ne suis pas tout à fait sur d'avoir compris le deuxième point. Il me semble que les identifiants sont données par la commande : rownames(EBV3$pere) et qu'il est possible d'accéder à la ligne désirée de la façon suivante : EBV3$pere["25",] Ne pas oublier les guillemets q...
par David Robelin
19 Mar 2010, 17:11
Forum : Questions en cours
Sujet : utilisation des vecteurs d'indice
Réponses : 10
Vues : 5490

Bonjour,

Pour ton premier problème, de nom de colonne numérique, tu peux les transformer en nombre en utilisant la fonction as.numeric(...)

David
par David Robelin
04 Mar 2010, 12:55
Forum : Questions en cours
Sujet : Combiner 2 dataframes en utilisant les noms de colonnes
Réponses : 6
Vues : 4994

Ca marche, et c'est assez efficace (rapide).

Merci beaucoup,

David
par David Robelin
03 Mar 2010, 15:50
Forum : Questions en cours
Sujet : Combiner 2 dataframes en utilisant les noms de colonnes
Réponses : 6
Vues : 4994

Tout à fait. C'est pour cette raison que je veux éviter de faire les 60000 fois 100 typages à la main. :D
J'édite mon message pour corriger cette erreur. Merci.
par David Robelin
03 Mar 2010, 15:28
Forum : Questions en cours
Sujet : Combiner 2 dataframes en utilisant les noms de colonnes
Réponses : 6
Vues : 4994

Combiner 2 dataframes en utilisant les noms de colonnes

Bonjour, Le titre n'est pas explicite, mais le problème est le suivant : j'ai deux tables en entrée ; la première, 'marker', contient le nom du marqueur, le chromosome et les deux allèles ; la deuxième, 'calling', contient le nom des marqueurs, l'individu (clone), ainsi que les deux allèles codé 'X'...
par David Robelin
28 Jan 2010, 16:31
Forum : Questions en cours
Sujet : Lire les fichiers d'un repertoire
Réponses : 5
Vues : 7200

Bonjour,

c'est l'erreur renvoyé quand read.table(...) ne trouve pas le fichier.
Tu n'es peut-être pas dans le répertoire que tu crois. Tu peux vérifier en faisant :

Code : Tout sélectionner

getwd()

Sinon, je ne vois pas.
par David Robelin
26 Jan 2010, 11:31
Forum : Questions en cours
Sujet : package spp
Réponses : 1
Vues : 1956

Bonjour,

Ta question est beaucoup trop vague.
Il n'existe pas de package spp dans le dépot R.

Pour les problèmes de ce genre, tu peux jeter un oeil ici :
http://www.rseek.org/

(ce qui donne par exemple : http://bm2.genes.nig.ac.jp/RGM2/R_curre ... n/spp.html )
par David Robelin
20 Jan 2010, 18:00
Forum : Questions en cours
Sujet : droite de tendance
Réponses : 1
Vues : 2096

oui.
par David Robelin
12 Jan 2010, 11:00
Forum : Questions en cours
Sujet : comparaison echantillon loi binomiale
Réponses : 9
Vues : 6752

Ah, mes excuses pour la fausse piste.

Généralement sur ce type de forum, un tel bouton existe, visible uniquement par celui qui a initié la discussion. Peut-être que ce bouton n'existe pas ici.
Il te suffit alors d'éditer ton premier message et d'ajouter "[Résolu]" au début du sujet.
par David Robelin
12 Jan 2010, 10:01
Forum : Questions en cours
Sujet : comparaison echantillon loi binomiale
Réponses : 9
Vues : 6752

De rien.
Merci de cliquer sur le bouton "Résolu", pour indiquer que ce problème est... résolu.
par David Robelin
12 Jan 2010, 08:10
Forum : Questions en cours
Sujet : comparaison echantillon loi binomiale
Réponses : 9
Vues : 6752

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Code : Tout sélectionner

 m0$fitted.values

Il s'agit des prédictions sous le modèle m0.

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