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par Jean-Pierre Rossi
27 Juin 2016, 15:30
Forum : Questions en cours
Sujet : Le package gene : géostatistiques & microsatellites
Réponses : 0
Vues : 1638

Le package gene : géostatistiques & microsatellites

Bonjour, Ce message pour vous informer de la diffusion sur R-Forge d’un nouveau package nommé « ggene ». Il s’agit d’un ensemble d’outils permettant le traitement géostatistiques de données microsatellites. L’article de Wagner et al (2005) expose le lien entre géostats et génétique et le package a é...
par Jean-Pierre Rossi
04 Oct 2015, 13:07
Forum : Questions en cours
Sujet : [Resolu] Création d'un PDF de documentation
Réponses : 4
Vues : 2115

Re: [Resolu] Création d'un PDF de documentation

Il y a également la commande
R CMD check --as-cran --output=chemin vers le dossier de sorite chemin vers le package
On obtient un test global du package (très utile) et la doc avec un sommaire, c'est à dire exactement le format qui est produit par le CRAN ou R-Forge par exemple.
par Jean-Pierre Rossi
02 Oct 2015, 09:48
Forum : Questions en cours
Sujet : gérer un package en développement sur R-Forge
Réponses : 2
Vues : 744

Re: gérer un package en développement sur R-Forge

Le problème principal ressemble beaucoup à un bug. Je ne trouvais pas la fenêtre avec le lien "edit keys" permettant d'envoyer la clé publique. En tant qu'admin, il semblerait logique d'avoir ce lien mais (et c'est là le bug) il n'en est rien. Il faut se connecter en tant qu'admin et se dé...
par Jean-Pierre Rossi
02 Oct 2015, 09:20
Forum : Questions en cours
Sujet : gérer un package en développement sur R-Forge
Réponses : 2
Vues : 744

Re: gérer un package en développement sur R-Forge

Alex, informaticien distingué du CBGP, vient de me donner la solution. Je posterai un message détaillé dans la journée au cas ou d'autres personnes se retrouvent confrontées aux mêmes problèmes.
Merci et bonne journée
par Jean-Pierre Rossi
01 Oct 2015, 20:06
Forum : Questions en cours
Sujet : gérer un package en développement sur R-Forge
Réponses : 2
Vues : 744

gérer un package en développement sur R-Forge

Bonsoir, Je souhaite développer un package R sur R-forge mais j'ai des problèmes pour me connecter en ssh sur le site R-forge. Je ne comprends pas bien ce qui cloche. Je travaille sous mac os. L'inscription R Forge est ok, le package déclaré et validé mais je bloque car je n'arrive pas à me connecte...
par Jean-Pierre Rossi
29 Mar 2011, 11:03
Forum : Questions en cours
Sujet : exporter une liste dans un fichier .CSV
Réponses : 14
Vues : 15574

Merci à vous 2 d'avoir pris du temps à me répondre. C'est ce que je pensais, je cherche depuis pas mal de temps une fonction qui pourrait faire cela proprement...Je bidouille depuis 1 moment en attendant de trouver une solution. Merci encore Naïma Bonjour, On peut sauver un objet R (une liste par e...
par Jean-Pierre Rossi
14 Mar 2011, 08:06
Forum : Questions en cours
Sujet : autocorrelation spatiale
Réponses : 4
Vues : 3895

Si vos données sont des positions de points, il y a le package spatstat (http://www.spatstat.org/spatstat/) qui est très complet et aussi splancs.
par Jean-Pierre Rossi
17 Jan 2011, 13:04
Forum : Questions en cours
Sujet : Gestion des projets sous R-Forge
Réponses : 0
Vues : 1208

Gestion des projets sous R-Forge

Bonjour,
J'ai créé un projet sous R-Forge et je commence à essayer de me familiariser avec ce système mais j'ai des difficultés. Quelqu'un aurait-il des liens vers de la doc en particulier sur le fonctionnement des dépôts(SVN) et des généralités sur Subversion?
merci!
PS: je travaille sous linux.
par Jean-Pierre Rossi
04 Oct 2010, 07:41
Forum : Questions en cours
Sujet : Lettres accentuées dans la doc des packages
Réponses : 2
Vues : 2849

Merci beaucoup Renaud!
par Jean-Pierre Rossi
01 Oct 2010, 13:08
Forum : Questions en cours
Sujet : Lettres accentuées dans la doc des packages
Réponses : 2
Vues : 2849

Lettres accentuées dans la doc des packages

Bonjour, Je travaille sur les fichiers *.Rd afin de documenter les fonctions d'un package que je développe. J'ai des problèmes avec les lettres accentuées qui ne sortent pas. Je sais utiliser la balise \eqn{} pour faire des équations avec la syntaxe LaTeX mais je n'ai pas trouvé l'équivalent pour le...
par Jean-Pierre Rossi
02 Juin 2010, 06:48
Forum : Questions en cours
Sujet : récupérer les quantiles
Réponses : 2
Vues : 3573

Re: récupérer les quantiles

Bonjour,

Code : Tout sélectionner

quantile(S,c(0.025,0.975))[1]
donne la valeur pour p=0.025 et

Code : Tout sélectionner

quantile(S,c(0.025,0.975))[2]
donne la valeur pour p=0.975.
par Jean-Pierre Rossi
20 Mai 2010, 08:45
Forum : Questions en cours
Sujet : problème avec makeindex pour faire un glossaire
Réponses : 3
Vues : 3450

Désolé... J'ai tellement pris l'habitude d'avoir des problèmes avec R, que je n'ai même pas réfléchi avant de poster ma question ici... J'ai lu à plusieurs endroit que le package glossary était obsolète et qu'il était remplacé par glossaries. Je pense de toute façon que j'aurais le même problème ca...
par Jean-Pierre Rossi
20 Mai 2010, 08:01
Forum : Questions en cours
Sujet : problème avec makeindex pour faire un glossaire
Réponses : 3
Vues : 3450

Re: problème avec makeindex pour faire un glossaire

Bonjour, je veux faire un glossaire avec le package glossaries. Je suis sur MikTex 2.8 et windows XP. Quand je compile mon fichier avec pdfLatex, il me créé bien les fichiers .ist et .glo. Ensuite, je n'arrive pas à créer les fichiers .glg et .gls. ça me donne le même résultat que je fasse avec le ...
par Jean-Pierre Rossi
28 Avr 2010, 08:35
Forum : Questions en cours
Sujet : utilisation R sous linux [résolu]
Réponses : 7
Vues : 6320

Je n'ai pas d'expérience dans l'importation de fichiers excel sous linux et je trouve la "manip" un peu tordue vu qu'excel est un standard microsoft! :shock: Il y a une solution simple qui marchera probablement: enregistrer le contenu du fichier excel en text (séparateur tabulation) à part...
par Jean-Pierre Rossi
28 Avr 2010, 06:36
Forum : Questions en cours
Sujet : utilisation R sous linux [résolu]
Réponses : 7
Vues : 6320

Re: utilisation R sous linux

Bonjour, Il y a 2 situations: 1-on dispose du package sur la machine (une archive de type tar.gz) et il suffit de taper (dans la console) la commande: R CMD INSTALL /home/..../nomdupackage.tar.gz ou 2-Depuis R taper: install.packages("nomdupackage") et dans ce cas le programme cherche le p...

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