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par herve chapuis
31 Mai 2023, 11:52
Forum : Questions en cours
Sujet : où se situe la valeur la plus proche de la moyenne ?
Réponses : 1
Vues : 773

où se situe la valeur la plus proche de la moyenne ?

Bonjour Je désire savoir s'il existe une fonction du style which.min() ou which.max() mais avec la fonction mean() ou median(). J'ai un tableau de valeurs (N individus et P variables) et je veux récupérer la ligne qui correspond à l'individu qui, dans la colonne Y a une valeur qui se rapproche le pl...
par herve chapuis
23 Mai 2023, 07:01
Forum : Questions en cours
Sujet : description table avec sqlQuery
Réponses : 3
Vues : 803

Re: description table avec sqlQuery

Merci ! :)
Je ne gagne pas énormément de temps (je n'ai pas mesuré exactement mais ça semble peu différent) mais au moins c'est plus élégant ! :)
Et j'aurai appris un truc.

Belle journée à toi.

Hervé
par herve chapuis
21 Mai 2023, 15:06
Forum : Questions en cours
Sujet : description table avec sqlQuery
Réponses : 3
Vues : 803

Re: description table avec sqlQuery

En fait j'ai pu résoudre ce problème par un select * qui m'a donné le nom de toutes les variables de la table. j'obtiens donc un dataframe avec l'identité de l'animal, la date de mesure, le tissu et le numéro de la mesure (elles sont répétées en différents points du tissu). Maintenant j'ai un souci ...
par herve chapuis
19 Mai 2023, 12:50
Forum : Questions en cours
Sujet : description table avec sqlQuery
Réponses : 3
Vues : 803

description table avec sqlQuery

Bonjour Je désire connaitre le contenu d'une table dans une base données attaquée depuis R avec RODBC. Je commence par ouvrir un channel en renseignant la table, l'userID et un mot de passe. Ensuite je tape une requête que je croyais simple : sqlQuery(channel,errors=T,query='describe sivol.SPECTRE_N...
par herve chapuis
24 Avr 2023, 15:00
Forum : Questions en cours
Sujet : importation de données. fichier "irrégulier"
Réponses : 6
Vues : 786

Re: importation de données. fichier "irrégulier"

Pour finir, j'ai eu du mal à comprendre read.fwf, mais m'en suis tiré avec read_fwf.

En tous cas merci de la suggestion ! :)
par herve chapuis
24 Avr 2023, 11:52
Forum : Questions en cours
Sujet : importation de données. fichier "irrégulier"
Réponses : 6
Vues : 786

Re: importation de données. fichier "irrégulier"

Nos messages se sont croisés.
Je regarde l'aide de read.fwf.
Merci
par herve chapuis
24 Avr 2023, 09:53
Forum : Questions en cours
Sujet : importation de données. fichier "irrégulier"
Réponses : 6
Vues : 786

Re: importation de données. fichier "irrégulier"

Finalement je pense avoir résolu mon problème en procédant en plusieurs étapes. 1. utilisation de readLines pedi<-data.frame(readLines("AGPOP_identif.new")) colnames(pedi)<-"chaine" 2. attribution des colonnes en découpant la chaine de caractère comme je le souhaite pedi$ID_ANIM<...
par herve chapuis
24 Avr 2023, 08:58
Forum : Questions en cours
Sujet : importation de données. fichier "irrégulier"
Réponses : 6
Vues : 786

importation de données. fichier "irrégulier"

Bonjour à tous Je désire importer un fichier en colonnes mais, hélas, avec un nombre de colonnes non constant. Sur 100000 ligne, la plupart du temps j'ai 8 colonnes. AGP 11150080 2 10APR2011 10330325 10310301 AGPD . AGP 11150127 2 10APR2011 10150356 10370301 AGPD . AGP 11150164 1 10APR2011 10040082 ...
par herve chapuis
27 Fév 2023, 12:39
Forum : Questions en cours
Sujet : tableau statistiques descriptives
Réponses : 11
Vues : 1311

tableau statistiques descriptives

Bonjour à tous. Je souhaite obtenir un tableau de statistiques descriptives pour certaines colonnes (col 13 à col 169 qui sont des données d'expression génique) d'un fichier. En tapant SUMMARY<-apply(Donnees[,c(13:169)],2,summary) j'obtiens une liste. Je souhaiterais plutôt un data.frame avec notamm...
par herve chapuis
03 Aoû 2021, 14:33
Forum : Questions en cours
Sujet : valeur des étiquettes de graduation
Réponses : 2
Vues : 1144

valeur des étiquettes de graduation

Bonjour C'est la suite de mon geom_bar()... Pour situer je veux tracer un barplot avec le nombre de descendants des pères et des mères. Ce nombre a été obtenu via un table et me semble être sans conteste numérique. Grâce aux conseils sur ma précédente question j'ai le graphe désiré (les colonnes dan...
par herve chapuis
03 Aoû 2021, 11:11
Forum : Questions en cours
Sujet : ordre des barres dans geom_bar
Réponses : 3
Vues : 1641

Re: ordre des barres dans geom_bar

Merci à vous !
nickel
par herve chapuis
03 Aoû 2021, 09:13
Forum : Questions en cours
Sujet : ordre des barres dans geom_bar
Réponses : 3
Vues : 1641

ordre des barres dans geom_bar

Bonjour Je voudrais produire un graphe avec le nombre de descendants par père, des plus prolifiques aux moins prolifiques. J'ai un fichier de pedigree (animal, père, mère) et j'obtiens l'effectif par reproducteur avec la fonction table listper<-table(ped_new$sire) listper<-data.frame(listper) listpe...
par herve chapuis
21 Fév 2020, 16:21
Forum : Questions en cours
Sujet : [RESOLU]création de doublons
Réponses : 2
Vues : 526

Re: création de doublons

Merci ! c'est effectivement cela ! Bien vu. J'avais essayé de regarder dans le fichier brut et n'avais rien trouvé d'évident... car les doublons sont répétés avec un intervalle de 559586 lignes. Et du coup ils m'avaient échappé. Je vais maintenant pouvoir m'adresser aux informaticiens locaux gestion...
par herve chapuis
21 Fév 2020, 15:36
Forum : Questions en cours
Sujet : [RESOLU]création de doublons
Réponses : 2
Vues : 526

[RESOLU]création de doublons

Bonjour à tous. Je me creuse la tête sans trouver de solution alors j'espère pouvoir glaner des indices ici. Hélas je suis incapable de fournir un code reproductible dans la mesure où le problème se manifeste sur un fichier de 26 M de lignes. Je lis des données issues de plusieurs automates de distr...
par herve chapuis
19 Fév 2020, 16:49
Forum : Questions en cours
Sujet : [RESOLU] filter ou pas filter
Réponses : 8
Vues : 979

Re: filter ou pas filter

Bonjour, Tout simplement parce-que la colonne "i" n'est pas égale à la colonne "dnais" filter(dta, dnais==!!i)#>     i  p  m sexe      dnais         IDANI        IDPERE        IDMERE F GEN annee#> 1 179  4 53    2 14/04/2016 GRI2016154875 GRI2015284632 GRI2015285783 0   1  2016#...

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