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par Benjamin Leduc
24 Juin 2022, 16:28
Forum : Questions en cours
Sujet : Comment avoir des symboles supplémentaires pour les graphiques?
Réponses : 3
Vues : 426

Comment avoir des symboles supplémentaires pour les graphiques?

Bonjour, J'ai une question toute bête, j'aimerais avoir des figurés supplémentaires pour des graphiques. Je cherche en particulier des "demis lunes" pour faire par exemple un rond avec un côté d'une couleur et l'autre moitié d'une autre couleur. Avez-vous une idée? Je vous remercie d'avance.
par Benjamin Leduc
03 Aoû 2021, 08:05
Forum : Questions en cours
Sujet : Issue avec plot() pour des données spatiales
Réponses : 6
Vues : 1193

Re: Issue avec plot() pour des données spatiales

Merci, Alors session info: R version 4.0.2 (2020-06-22) Platform: x86_64-apple-darwin17.0 (64-bit) Running under: macOS 10.16 Matrix products: default BLAS: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/lib/libRblas.dylib LAPACK: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/lib/li...
par Benjamin Leduc
30 Juil 2021, 17:12
Forum : Questions en cours
Sujet : Issue avec plot() pour des données spatiales
Réponses : 6
Vues : 1193

Re: Issue avec plot() pour des données spatiales

Savez-vous comment avoir un texte de détail sur une fonction plot()?
par Benjamin Leduc
30 Juil 2021, 12:10
Forum : Questions en cours
Sujet : Issue avec plot() pour des données spatiales
Réponses : 6
Vues : 1193

Issue avec plot() pour des données spatiales

Bonjour, Je cherche à refaire des cartes, mais à un moment où un autre, R ne fait plus rien. code minimal: library(sp) plus.coordinates <- rbind(c(1.5, 1.25), c(1.75, 1.25), c(2.25, 1.25), c(2.5, 1.25), #horizontal c(2, 1.75), c(2, 1.5), c(2, 1), c(2, 0.75), #vertical c(2, 1.25)) #center first.spati...
par Benjamin Leduc
06 Juin 2021, 20:35
Forum : Questions en cours
Sujet : tracés de shapefiles avec couleurs
Réponses : 1
Vues : 404

tracés de shapefiles avec couleurs

Bonjour, J'essaye de faire une carte avec des couleurs selon un shapefile disponible sur le cadastre français. pour le choix des couleurs, j'ai fait un fichier: > parcdata parcelle Col 1 602400000A0186 blue 2 602400000A0190 blue 3 602400000B0094 blue 4 602400000B0257 green 5 602400000B0345 green 6 6...
par Benjamin Leduc
29 Avr 2021, 08:04
Forum : Questions en cours
Sujet : Faire des triangles
Réponses : 3
Vues : 618

Re: Faire des triangles

Merci, c'est en effet ça!

J'ai essayé de craquer le code, mais je n'y arrive pas, comment faire un algorithme simple en R pour avoir juste la première colonne (celle entre parenthèse)

Merci
par Benjamin Leduc
28 Avr 2021, 07:39
Forum : Questions en cours
Sujet : Faire des triangles
Réponses : 3
Vues : 618

Faire des triangles

Bonjour, Je cherche à faire des triangles qui pavent un ensemble de points. Je m'explique: > GenData<-cbind(sample(1:10,10),sample(1:10,10)) > GenData [,1] [,2] [1,] 7 3 [2,] 4 6 [3,] 1 7 [4,] 8 10 [5,] 9 8 [6,] 2 9 [7,] 10 4 [8,] 6 1 [9,] 3 5 [10,] 5 2 > plot(GenData) Si l'on regarde cette exemple,...
par Benjamin Leduc
26 Juin 2020, 14:22
Forum : Questions en cours
Sujet : Comment réaliser un median-joining network sous R
Réponses : 5
Vues : 717

Re: Comment réaliser un median-joining network sous R

Merci Maxime pour votre réponse,

J'ai testé l'exemple de l'aide, et ça doit pouvoir le faire.

J'avais déjà utilisé la bibliothèque "pegas" (je n'avais pas vraiment été convaincu à l'époque). Alors je teste cette fonction avec un jeu de donné, et, je vous donnerais le retour ;)
par Benjamin Leduc
25 Juin 2020, 11:16
Forum : Questions en cours
Sujet : Comment réaliser un median-joining network sous R
Réponses : 5
Vues : 717

Re: Comment réaliser un median-joining network sous R

Merci pour votre réponse.

Plutôt que de lire le M&M, j'ai demandé au statisticiens de la boite ayant produit le graphique… C'est un logiciel maison qui est utilisé. Il y a un logiciel assez cher pour le produire. Et Je souhaite le faire sur R.
par Benjamin Leduc
15 Juin 2020, 15:28
Forum : Questions en cours
Sujet : Comment réaliser un median-joining network sous R
Réponses : 5
Vues : 717

Comment réaliser un median-joining network sous R

Bonjour, Petit suget pour ceux qui font de la génétique. J'ai envie d'essayer de produire un graphique de type median-joining network (Bandelt HJ et al1999) sous R. Avez-vous une idée de comment procéder? https://www.nejm.org/na101/home/literatum/publisher/mms/journals/content/nejm/2020/nejm_2020.38...
par Benjamin Leduc
08 Fév 2019, 13:59
Forum : Questions en cours
Sujet : Creer une fonction pour charger un fichier d'une autre application?
Réponses : 8
Vues : 1422

Re: Creer une fonction pour charger un fichier d'une autre application?

Merci, ça marche, il manque juste un petit "library(dplyr)" , mais j'ai trouvé ;)
par Benjamin Leduc
07 Fév 2019, 18:38
Forum : Questions en cours
Sujet : Creer une fonction pour charger un fichier d'une autre application?
Réponses : 8
Vues : 1422

Re: Creer une fonction pour charger un fichier d'une autre application?

Merci… J'essaye au plus vite… Je suis HS après une dure journée de labo…
par Benjamin Leduc
07 Fév 2019, 12:10
Forum : Questions en cours
Sujet : Creer une fonction pour charger un fichier d'une autre application?
Réponses : 8
Vues : 1422

Re: Creer une fonction pour charger un fichier d'une autre application?

Bonjour, désolé d'avoir été long à répondre… Alors mon fichier d'entré est comme ça: >Cluster 0 0 586nt, >Sb-40_M02764:115:000000000-C3GKK:1:2104:21327:3911... * >Cluster 1 0 585nt, >Sb-40_M02764:115:000000000-C3GKK:1:1114:8463:18775... * >Cluster 2 0 576nt, >Sb-40_M02764:115:000000000-C3GKK:1:2105:...
par Benjamin Leduc
07 Fév 2019, 11:59
Forum : Questions en cours
Sujet : Carte simple sous R
Réponses : 7
Vues : 2674

Re: Carte simple sous R

J'ai plein de truc pour les cartes… J'en ai fait pas mal, avec des petits plus… cartes thérmique, anamorphoses
par Benjamin Leduc
05 Fév 2019, 19:59
Forum : Questions en cours
Sujet : Carte simple sous R
Réponses : 7
Vues : 2674

Re: Carte simple sous R

Salut, Une carte simple à partir d'un shapefile? library(rgdal) ça permet aussi je changer la projection… Débutant à quel point? J'avais fait un tuto, mais il n'est plus en ligne, vouci le texte: Apprendre à tracer une carte de France à l'aide d'un ordinateur En l'an 2000, lors d'une discussion sur ...

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