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par Christian Dina
04 Mar 2019, 13:36
Forum : Questions en cours
Sujet : Clustering gaussien avec effet batch et incroporation d'information
Réponses : 3
Vues : 671

Re: Clustering gaussien avec effet batch et incroporation d'information

En effet. Pourriez-vous m'indiquer une package R qui fasse cela ?
Cordialement
par Christian Dina
04 Mar 2019, 11:13
Forum : Questions en cours
Sujet : Clustering gaussien avec effet batch et incroporation d'information
Réponses : 3
Vues : 671

Clustering gaussien avec effet batch et incroporation d'information

Bonjour, je voudrais faire du clustering/assignation de données quantitatives uni- ou bi-dimensionnelles : - réparties en batches (donc avec un effet batch). - ou je connais l'assignation pour un individu répété (dans chaque batch). J'ai vu ber (batch effects removal), mais qui se semble en 1 dimens...
par Christian Dina
04 Mar 2019, 10:49
Forum : Questions en cours
Sujet : Régression logistique sur données imputées (multiples)
Réponses : 2
Vues : 708

Re: Régression logistique sur données imputées (multiples)

Bonjour Mickaël,
je viens juste de voir ta réponse (mieux vaut tard que jamais). Désolé, apparemment j'ai mal paramétré mes notifs.
Merci beaucoup
Amitiés
Christian
par Christian Dina
18 Avr 2018, 11:48
Forum : Questions en cours
Sujet : Régression logistique sur données imputées (multiples)
Réponses : 2
Vues : 708

Régression logistique sur données imputées (multiples)

Bonjour, j'ai des données imputées (de type génotype) ou j'ai estimé les probabilités des valeurs par une méthode spécifiques. Je voudrais tirer au sort différentes réalisations de cet échantillon. Je voudrais ensuite utiliser l'équivalent d'un "pooling" comme celui de MICE pour estimer un...
par Christian Dina
06 Juin 2013, 08:28
Forum : Questions en cours
Sujet : Graphe géographique
Réponses : 1
Vues : 1088

Graphe géographique

Bonjour, j'ai un ensemble de points sur une carte en 2 dimensions, qui appartiennent à N groupes. Je voudrais trouver une fonction graphique qui me permette "d'entourer" (un ligne irrégulière fermée) le X% (75% par exemple) des individus appartenant à un groupe ... Je pourrais calculer le ...
par Christian Dina
18 Avr 2013, 12:38
Forum : Questions en cours
Sujet : Créer une interface de type Menu déroulant
Réponses : 2
Vues : 2405

Créer une interface de type Menu déroulant

Bonjour,

je voudrais créer quelques fonctions R qui puissent être utilisées par des gens qui ne programment pas. Existe-t-il un système "facile" créer un environnement "fenêtre/menu déroulant".

Pour imiter leur sigmastat préféré ?

Cordialement,

Christian
par Christian Dina
03 Avr 2013, 21:24
Forum : Questions en cours
Sujet : Imputation en régression logistiques
Réponses : 14
Vues : 4991

Pour clore ce topic. J'ai essayé l'imputation multiple (Little, Rubin) ne pas confondre avec imputation génétique. J'ai l'impression que cela convient bine au problème et est + facile à coder (pour moi). Ca fait plus bourrin que la maximisation avec données observées + manquantes mais j'assume. Et R...
par Christian Dina
28 Mar 2013, 15:53
Forum : Questions en cours
Sujet : Imputation en régression logistiques
Réponses : 14
Vues : 4991

Pour l'exemple, il s'agissait d'un individu et de son génotype à deux SNPs ... Pour chaque SNP, il y a trois probabilités pour les trois génotypes possibles .. Sinon, c'est bien ce que je pensais, il faudrait que j'étende le modèle développé dans http://mathgen.stats.ox.ac.uk/genetics_software/snpte...
par Christian Dina
28 Mar 2013, 14:41
Forum : Questions en cours
Sujet : Imputation en régression logistiques
Réponses : 14
Vues : 4991

Pourquoi 2 (à N) SNPs au lieu d'un seul : - une fois qu'on a trouvé des SNPs en association (chacun étant proche d'un gène donné), nous voulons typiquement estimer les poids des SNPs - pris dans leur ensemble - associés dans la survenue d'une pathologie (ou la variance d'un trait). On peut faire de ...
par Christian Dina
28 Mar 2013, 12:52
Forum : Questions en cours
Sujet : Imputation en régression logistiques
Réponses : 14
Vues : 4991

Merci pour ces réponses. J'utilise en effet SNPTEST et aussi (très peu) GenAbel. Donc je maîtrise (grâce aux gens qui ont codé le test) pour un seul SNP - avec toutes les limitations d'analyser des nouvelles variables imputées qui sont par essence corrélées avec les variables (marqueurs génétiques) ...
par Christian Dina
28 Mar 2013, 07:58
Forum : Questions en cours
Sujet : Imputation en régression logistiques
Réponses : 14
Vues : 4991

Tout à fait. Je dois aller sur un forum plus adapté car je me rends compte que je dois faire appel à plusieurs notions simples (rien d'extraordinaire) sur la structure des données. Je vais donc migrer Juste pour info : 3 génotypes possible pour un individu: AA AG GG Soit le gars, on connaît son géno...
par Christian Dina
27 Mar 2013, 21:37
Forum : Questions en cours
Sujet : Imputation en régression logistiques
Réponses : 14
Vues : 4991

Merci pour cette réponse. Il n'y avait pourtant aucune intention de sélection dans cette question - dans le sens voir qui comprend ou non. Je pense que je vais la migrer sur un forum de génétique stat (même s'il n'y en aucun correspondant exactement à cela) ou le cas est beaucoup plus courant et &qu...
par Christian Dina
27 Mar 2013, 16:14
Forum : Questions en cours
Sujet : Imputation en régression logistiques
Réponses : 14
Vues : 4991

Imputation en régression logistiques

Bonjour, j'ai un problème qui me semble assez spécifique (mais je peux me tromper). J'ai un vecteur de statuts (0/1) et des co-variables qui sont, en principe ordinales (valeurs de 0 à 5). Pour certains individus, nous n'avons pas la valeur exacte mais plutôt un distribution de probabilité Individu ...
par Christian Dina
31 Aoû 2012, 12:37
Forum : Questions en cours
Sujet : Graphique sans abscisses et/ou ordonnées
Réponses : 2
Vues : 1930

Merci
par Christian Dina
31 Aoû 2012, 12:12
Forum : Questions en cours
Sujet : Graphique sans abscisses et/ou ordonnées
Réponses : 2
Vues : 1930

Graphique sans abscisses et/ou ordonnées

Bonjour

je n'arrive pas à voir d'option pour supprimer l'abscisse et/ou l'ordonnée sur un simple graphe.

Pouvez-vous m'aider

Christian

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