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par Jérémie Habasque
27 Jan 2015, 16:59
Forum : Questions en cours
Sujet : Conversion de date MATLAB sous R
Réponses : 1
Vues : 1138

Il suffit d'utiliser as.POSIXct directement.

Code : Tout sélectionner

time.ER60 <- as.POSIXct(data$time[1,],origin="1970-01-01",tz='GMT')
par Jérémie Habasque
27 Jan 2015, 14:32
Forum : Questions en cours
Sujet : parcourir une liste
Réponses : 2
Vues : 3956

Bonjour, En utilisant des expressions régulières ? Un peu de lecture : http://www.duclert.org/Aide-memoire-R/Le-langage/Chaines-de-caracteres.php Un exemple rapide: vecteur=c("1222133123123") positions_sequences <- gregexpr(c("12"), vecteur) nb_sequences <...
par Jérémie Habasque
27 Jan 2015, 13:54
Forum : Questions en cours
Sujet : Conversion de date MATLAB sous R
Réponses : 1
Vues : 1138

Conversion de date MATLAB sous R

Bonjour, Je souhaiterais convertir une date Matlab en format date R. Par exemple, sous MATLAB la valeur de ma date est: 13735196586055 soit le 11-Jul-2013 05:14:18 Ci-dessous le code que j'utilise: data <- readMat(filename_matlab) date.time <- as.Date(((data$time[1,]/86400)+7...
par Jérémie Habasque
25 Nov 2014, 15:22
Forum : Questions en cours
Sujet : Trait de côte avec ggplot et calcul de distance
Réponses : 2
Vues : 3392

Finalement, je passe par la fonction Rgshhs du package maptools. Il faut télécharger le fichier binaire ici http://www.soest.hawaii.edu/pwessel/gshhg/gshhg-bin-2.3.0.zip puis le dézipper. Et ensuite utiliser le code suivant : cote<-Rgshhs("C:/Users/.../Desktop/GSHHS/gshhg-bin-2.3.0/gshhs_f....
par Jérémie Habasque
20 Nov 2014, 08:48
Forum : Questions en cours
Sujet : Trait de côte avec ggplot et calcul de distance
Réponses : 2
Vues : 3392

Trait de côte avec ggplot et calcul de distance

Bonjour, A partir de mon jeu de données (points de mesures effectuées au large des côtes marocaines) je souhaiterais : 1- Cartographier les points avec des valeurs associées en ajoutant le polygone du continent, en distinguant les mesures de jour et de nuit. 2- Calculer la distance entre chaque poin...
par Jérémie Habasque
24 Oct 2014, 13:34
Forum : Questions en cours
Sujet : Utilisation des fonctions ENFA du package adehabitatHS
Réponses : 6
Vues : 5083

Un petit up sur le sujet. Avec la fonction predict du package adehabitat, je pouvais remettre les 34310 observations sur une grille de dimension 360*180 sst_asc <-­ asc.from.raster(raster(sst_climato)) chl_asc <­- asc.from.raster(raster(chloro_climato)) predictors_enf...
par Jérémie Habasque
15 Oct 2014, 13:54
Forum : Questions en cours
Sujet : Utilisation des fonctions ENFA du package adehabitatHS
Réponses : 6
Vues : 5083

Bonjour, Merci en effet, maintenant la fonction dudi.pca fonctionne ! predictors_enfa <- stack(raster(sst_climato),raster(chloro_climato)) names(predictors_enfa)=c("SST","CHL") predictors_enfa <- as(predictors_enfa,'SpatialPixelsDataFra...
par Jérémie Habasque
15 Oct 2014, 07:39
Forum : Questions en cours
Sujet : Utilisation des fonctions ENFA du package adehabitatHS
Réponses : 6
Vues : 5083

Bonjour, En effet, il y a des NA en entrée de la fonction dudi.pca: > str(predictors_enfa) Formal class 'SpatialPixelsDataFrame' [package "sp"] with 7 slots ..@ data :'data.frame': 39642 obs. of 2 variables: .. ..$ SST: num [1:39642] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ... .. ..$ CHL: nu...
par Jérémie Habasque
14 Oct 2014, 10:02
Forum : Questions en cours
Sujet : Utilisation des fonctions ENFA du package adehabitatHS
Réponses : 6
Vues : 5083

Utilisation des fonctions ENFA du package adehabitatHS

Bonjour, Je souhaite utiliser les fonctions d'ENFA du package 'adehabitatHS'. Une erreur apparaît avec la fonction dudi.pca concernant la présence de NA. Cf. le code ci-dessous: predictors_enfa <- stack(raster(sst_climato),raster(chloro_climato)) predictors_enfa <- as(pre...
par Jérémie Habasque
26 Fév 2014, 13:24
Forum : Questions en cours
Sujet : scalebar sur plot de type vis.gam
Réponses : 2
Vues : 2100

Merci pour le code !
Dommage que l'on soit obligé de passer par 2 figures et qu'il n'y ait pas une option colorbar dans la fonction vis.gam...
par Jérémie Habasque
26 Fév 2014, 08:24
Forum : Questions en cours
Sujet : scalebar sur plot de type vis.gam
Réponses : 2
Vues : 2100

scalebar sur plot de type vis.gam

Bonjour,

Je souhaiterais savoir s'il est possible d'ajouter une scalebar / une colorbar à un graphique de type vis.gam ?
http://stat.ethz.ch/R-manual/R-patched/ ... s.gam.html

Merci d'avance,
par Jérémie Habasque
12 Fév 2014, 10:33
Forum : Questions en cours
Sujet : GAM et interaction
Réponses : 3
Vues : 1865

Bonjour, Petit update de ce post. La solution trouvée pour l'interprétation du modèle a été de passer par une visualisation en 2D par l'utilisation de l'option 'plot.type="contour"' de la fonction vis.gam du package mgcv : vis.gam(model,view=c("CHLA","SST"),...
par Jérémie Habasque
23 Jan 2014, 16:39
Forum : Questions en cours
Sujet : GAM et interaction
Réponses : 3
Vues : 1865

Bonjour,

Je relance le topic...

Merci,
par Jérémie Habasque
14 Jan 2014, 17:13
Forum : Questions en cours
Sujet : GAM et interaction
Réponses : 3
Vues : 1865

Finalement j'ai opté pour la formule suivante : gam(W ~ te(X, log(Y)),data=dataset,family="binomial") En revanche, l'interprétation du graphique résultat du modèle est assez complexe... http://www.casimages.com/img.php?i=14011406325417122511899120.png Si quelqu'un a...
par Jérémie Habasque
10 Jan 2014, 16:22
Forum : Questions en cours
Sujet : GAM et interaction
Réponses : 3
Vues : 1865

GAM et interaction

Bonjour, Je teste actuellement un GAM avec la formule suivante : gam(W~s(X,by=log(Y)),data=dataset,family="binomial") Est-ce que le fait d'introduire le paramètre "by" correspond d'une manière à une interaction X*log(Y) ? Il y a peu de documentation sur ce...

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