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Bonjour, J'aimerai faire un GLM avec comme variable à expliquer la richesse spécifique par habitat étudié. Comme je travaille sur des coléoptères carabiques que je piège par pot d'interception au sol, j'ai standardisé ma richesse spécifique par l'abondance minimum observée (n=3). J'obtiens donc des ...

Pour plus de précisions, voilà ce que je viens d'essayer : [global.model.nmds1 = glmer.nb(nmds1~area+age+nnd+F100+ppt+pptwar+ (1|region/window_ty+(1|patch),interval=log(th)+c(-3,3),verbose=F,data=data3)] Ce qui me donne le message d'erreur suivant : Error in eval(expr, envir, enclos) : negative valu...

Bonjour, Etant dans un modèle avec effet aléatoire, je me suis donc concentrée dans un premier temps sur la fonction glmer.nb de lme4. Mais je ne comprends pas du tout comment implémenter la ligne de code. Voici ce que j'ai fait : global.model= glmer.nb(nmds1~area+age+nnd+F100+ppt+pptwar, (1|window)...

Bonjour à tous, Afin de prendre en compte la composition spécifique de mes différents sites d'étude en variable dépendante, j'ai réalisé une analyse NMDS sur la matrice sites x espèces. Je souhaiterai maintenant réaliser un GLM avec les coordonnées du premier axe comme variable dépendante qui varie ...

Merci à tous les 2, ça marche impeccablement !

Bonjour à tous, J'ai une matrice d'abondances d'espèces échantillonnées dans des fragments forestiers. J'ai 8 pièges (colonne 1) par fragment (colonne2) et j'aimerai faire la somme des abondances de chacune de mes espèces pour chacun de mes fragments. En gros j'ai ça : code_point patch sp1 sp2 sp3 s...