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par Myriam Croze
04 Avr 2019, 06:40
Forum : Questions en cours
Sujet : mean sous conditions
Réponses : 2
Vues : 580

mean sous conditions

Bonjour, Je souhaite calculer la moyenne d'une colonne de mon tableau en fonction des valeurs d'une autre colonne. Voilà à quoi ressemble mon tableau (TableS1): Days1 Deme1 Deme2 value modif Deme 36.5 4 6 0.51 0.49 46 40 6 6 0.20 0.19 66 51 6 6 0.19 0.17 66 38 3 5 0.22 0.20 35 59 8 2 0.23 0.22 82 .....
par Myriam Croze
30 Oct 2018, 11:19
Forum : Questions en cours
Sujet : Figure matrice de distance
Réponses : 0
Vues : 3488

Figure matrice de distance

Bonjour, Grâce au package Ape de r, j'ai calculé la matrice de distance d'un alignement de séquence ADN. Mon problème, c'est que je ne sais pas comment faire un graphe à partir de ces données. Voilà le fichier/matrice que j'ai: 4516 5123 4891 6425 9842 7852 8425 4516 0 5123 0,001 0 4891 0,025 0,0036...
par Myriam Croze
10 Mai 2014, 15:30
Forum : Questions en cours
Sujet : Recuperer des donnees d'une liste
Réponses : 2
Vues : 1347

Merci pour ta reponse.
J'ai finalement reussi a faire le script.
par Myriam Croze
07 Mai 2014, 16:50
Forum : Questions en cours
Sujet : Recuperer des donnees d'une liste
Réponses : 2
Vues : 1347

Recuperer des donnees d'une liste

Bonjour, Voila j'ai deux tableaux qui se presente sous ce format: Tableau1: Start End 1 1185001 1186000 2 1199001 1200000 3 1537001 1538000 4 1610001 1611000 5 1611001 1612000 6 1732001 1733000 7 1969001 1970000 .. ... ... Tableau 2: Genes FB_Genes Start End 1 CG11023 FBgn0031208 7529 9484 2 l(2)gl ...
par Myriam Croze
19 Déc 2013, 12:00
Forum : Questions en cours
Sujet : Analyses de plusieurs fichiers
Réponses : 8
Vues : 3461

Merci beaucoup,
le fichier fonctionne maintenant.

Par contre quelqu'un aurait-il une idee pour ma deuxieme question?
C'est a dire comment rassembler les donnees d'une colonne de plusieurs fichiers en un seul fichier? Faut-il utiliser "cat"?

Merci.
par Myriam Croze
19 Déc 2013, 10:02
Forum : Questions en cours
Sujet : Analyses de plusieurs fichiers
Réponses : 8
Vues : 3461

Apres une journee a essayer de faire marcher le code que vous me proposez, je dois m'avoure vaincu. En effet je n'arrive pas a obtenir de resultats. Quand je le lance, j'obtiens ce message d'erreur: Error in file(file, "rt") : cannot open the connection In addition: Warning message...
par Myriam Croze
18 Déc 2013, 08:20
Forum : Questions en cours
Sujet : Analyses de plusieurs fichiers
Réponses : 8
Vues : 3461

Merci pour vos reponses.
Je vais essayer ca.
par Myriam Croze
17 Déc 2013, 12:26
Forum : Questions en cours
Sujet : Analyses de plusieurs fichiers
Réponses : 8
Vues : 3461

Analyses de plusieurs fichiers

Bonjour, je voudrais analyser plusieurs fichiers (une centaine) dont le nom est sous cette forme: Output_"date". Ces fichiers sont organiser de la meme facon c'est a dire que j'ai les meme colonnes (Gene, Pi, Theta, TajimaD, etc) pour chaque. Je voudrais calculer la moyenne et le quantile ...
par Myriam Croze
11 Mai 2013, 14:49
Forum : Questions en cours
Sujet : Likelihood Ratio
Réponses : 0
Vues : 937

Likelihood Ratio

Bonjour, Je souhaite faire un likelihood ratio sur 2 jeux de données. Voila à quoi ils ressemblent: Mode neutre ML T theta(Fenbbg1) k(Fenbbg1) theta(Fenbbg2) k(Fenbbg2) -547.862 9.16128 0.0056878 1 0.00477993 1 -553.064 8.36273 0.00621793 1 0.0051492 1 -546.515 9.37787 0.0053649 1 0.00457811 1 Mode ...
par Myriam Croze
11 Mai 2013, 14:44
Forum : Questions en cours
Sujet : Deviation nombres aleatoires
Réponses : 5
Vues : 1912

Merci pour ton aide.
J'ai reussi a faire mon graphe.
par Myriam Croze
08 Mai 2013, 07:29
Forum : Questions en cours
Sujet : Deviation nombres aleatoires
Réponses : 5
Vues : 1912

Merci pour ta reponse perceval. Mais ce n'est pas exactement ce que je veux. En fait ce que je voudrais, c'est sur un seul graphes, avoir plusieurs boxplot pour differentes valeurs de tirage au sort. Et je voudrais voir la variation par rapport a la moyenne. En gros je voudrais savoir a partir de qu...
par Myriam Croze
07 Mai 2013, 16:14
Forum : Questions en cours
Sujet : Deviation nombres aleatoires
Réponses : 5
Vues : 1912

Deviation nombres aleatoires

Bonjour, Je travail sur R et je n'arrive pas a fair un graphe. Je veux tirer au sort aleatoirement des valeurs d'une table de donnees. Et je veux regarder a partir de quand la variance se stabilise. C'est a dire, si je tire 10, 20, 30, ......valeurs, a partir de quand j'aurais la meme variation. Pou...
par Myriam Croze
29 Jan 2013, 08:18
Forum : Questions en cours
Sujet : Normalisation de mes donnees et aire sous la courbe
Réponses : 10
Vues : 5592

Merci pour l'aide.
J'ai reussi a tracer ma courbe avec le code de Vincent.
par Myriam Croze
25 Jan 2013, 10:13
Forum : Questions en cours
Sujet : Normalisation de mes donnees et aire sous la courbe
Réponses : 10
Vues : 5592

Bonjour, j'ai finalement reussi a faire mon histogramme et a avoir la valeur des 5%. De meme, j'arrive a tracer la courbe des densites. Voila mon code: # read in the data TajimasD_table<-read.table("D:/PhD/Myriam_TajimasD.csv", sep=",", header=TRUE) # store Tajima"s ...
par Myriam Croze
24 Jan 2013, 08:48
Forum : Questions en cours
Sujet : Normalisation de mes donnees et aire sous la courbe
Réponses : 10
Vues : 5592

Merci pour ces informations.
Je vais regarder l'aide en esperant finir par y arriver.

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