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par Laure Trudel
12 Mar 2019, 23:31
Forum : Questions en cours
Sujet : Fonction vmask - package argosfilter
Réponses : 1
Vues : 44

Fonction vmask - package argosfilter

J'ai fait tourner la fonction vmask comme suit et j'obtiens cette erreur: speedfilter <- plyr::ddply(tab,~Ptt, argosfilter::vmask(tab$Latitude, tab$Longitude, tab$DateTime, vmax=4)) Error in get(as.character(FUN), mode = "function", envir = envir) : object 'end_location' of mode 'function'...
par Laure Trudel
11 Mar 2019, 22:55
Forum : Questions en cours
Sujet : problème de mémoire "cannot allocate vector of size n Mb"
Réponses : 8
Vues : 165

Re: problème de mémoire "cannot allocate vector of size n Mb"

Merci pour votre message. j'ai enfin réussi à régler mon problème en passant par un serveur !
par Laure Trudel
11 Mar 2019, 19:49
Forum : Questions en cours
Sujet : rgdal package - problème installation
Réponses : 6
Vues : 84

Re: rgdal package - problème installation

Je confirme que dans mon cas certains packages devaient être installés depuis l'administrateur. Le problème a été résolu en demandant aux administrateurs d'installer rgdal.
par Laure Trudel
10 Mar 2019, 15:30
Forum : Questions en cours
Sujet : rgdal package - problème installation
Réponses : 6
Vues : 84

Re: rgdal package - problème installation

merci pour votre réponse ça confirme ce que je pensais .
par Laure Trudel
09 Mar 2019, 19:11
Forum : Questions en cours
Sujet : rgdal package - problème installation
Réponses : 6
Vues : 84

Re: rgdal package - problème installation

quand je fait la commande :
yum install gdal gdal-devel
j'ai ça comme message

-bash-4.2$ yum install gdal gdal-devel
Loaded plugins: fastestmirror, langpacks, remove-with-leaves
You need to be root to perform this command.
par Laure Trudel
09 Mar 2019, 19:10
Forum : Questions en cours
Sujet : rgdal package - problème installation
Réponses : 6
Vues : 84

Re: rgdal package - problème installation

Bonjour,

J'ai vu ces commandes sur d'autres forums mais je n'ai pas linux j'ai windows donc je ne peux pas installer ça ?
Faut-il que ce soit les informaticiens responsable du serveur qui le fasse ?

Merci
par Laure Trudel
08 Mar 2019, 20:11
Forum : Questions en cours
Sujet : rgdal package - problème installation
Réponses : 6
Vues : 84

rgdal package - problème installation

Je rencontre un problème pour installer le package rgdal alors que j'utilise R sur le terminal d'un serveur. J'utilise windows . install.packages('rgdal') voilà ce que j'obtiens: downloaded 1.6 MB * installing *source* package ‘rgdal’ ... ** package ‘rgdal’ successfully unpacked and MD5 sums checked...
par Laure Trudel
06 Mar 2019, 00:54
Forum : Questions en cours
Sujet : problème de mémoire "cannot allocate vector of size n Mb"
Réponses : 8
Vues : 165

Re: problème de mémoire "cannot allocate vector of size n Mb"

Je vais expliquer les différentes étapes de ma démarche pour que ça osir plus claire. Peut-être que vous pourrez m'aider à améliorer mon code pour avoir des fichiers moins gros ou changer des choses pour que ça soit plus efficace. 1. J'ai deux types de fichier netcdf que je veux regrouper mais qui n...
par Laure Trudel
05 Mar 2019, 15:50
Forum : Questions en cours
Sujet : problème de mémoire "cannot allocate vector of size n Mb"
Réponses : 8
Vues : 165

Re: problème de mémoire "cannot allocate vector of size n Mb"

Oui je ne vais pas aller très loin avec 1e+10 bits (~1.25Gb) donc je peux mettre plus. J'ai 15.9 Go de RAM sur mon ordi donc ça ne va pas être suffisant pour 20.4 Gb. Sinon un serveur si je peux y avoir accès ?


Merci
par Laure Trudel
04 Mar 2019, 22:47
Forum : Questions en cours
Sujet : problème de mémoire "cannot allocate vector of size n Mb"
Réponses : 8
Vues : 165

Re: problème de mémoire "cannot allocate vector of size n Mb"

Bonjour,

Merci.
ET comment fait-on pour augmenter la ram car j'ai un 64 bits ?

Merci, Laurène
par Laure Trudel
01 Mar 2019, 23:02
Forum : Questions en cours
Sujet : problème de mémoire "cannot allocate vector of size n Mb"
Réponses : 8
Vues : 165

problème de mémoire "cannot allocate vector of size n Mb"

Bonjour, Une question récurrente le problème de mémoire ! J'ai un rasterStack assez gros pour lequel j'aimerais calculer une moyenne sur l'ensemble des couches. class : RasterStack dimensions : 720, 1440, 1036800, 1464 (nrow, ncol, ncell, nlayers) resolution : 0.25, 0.25 (x, y) extent : -180, 180, -...
par Laure Trudel
28 Fév 2019, 19:07
Forum : Questions en cours
Sujet : moyenne de fichiers netcdf qui n'ont pas la même structure
Réponses : 0
Vues : 43

moyenne de fichiers netcdf qui n'ont pas la même structure

Bonjour, J'ai plusieurs fichiers netcdf de SST dont je voudrais faire la moyenne. J'avais trouvé comment faire mais j'ai du télécharger de nouveaux fichiers qui ne viennent pas du même produit et qui n'ont pas la même structure. J'ai des fichiers à 8 variables et d'autres à 3. Je voudrais savoir si ...
par Laure Trudel
28 Fév 2019, 18:45
Forum : Questions en cours
Sujet : raster - extraire une ligne correspondant à un isotherm
Réponses : 1
Vues : 102

Re: raster - extraire une ligne correspondant à un isotherm

Problème résolu ! Pour ceux que ça intéresse il faut utiliser la fonction cut library(raster) vol <- raster(volcano) # bien definir l’argument breaks pour inclure ou exclure les valeurs souhaitées vol160 <- cut(vol, breaks = c(0, 160, 200)) plot(rasterToContour(vol160, nlevels = 1)) plot(rasterToPol...
par Laure Trudel
15 Fév 2019, 22:47
Forum : Questions en cours
Sujet : raster - extraire une ligne correspondant à un isotherm
Réponses : 1
Vues : 102

raster - extraire une ligne correspondant à un isotherm

Bonjour, Peut-être que ma réponse est déjà dans une discussion mais bien qu'ayant cherché je ne l'ai pas trouvée. j'ai créée un rasterlayer correspond à la température de surface moyenne sur l'ensemble du globe sur plusieurs années. Maintenant je cherche à extraire un isotherm précis (21°C) de cette...

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