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par Anais Edme
12 Mar 2018, 08:51
Forum : Questions en cours
Sujet : Pedigreemm
Réponses : 0
Vues : 1489

Pedigreemm

Bonjour j'utilise le package pedigreemm pour calculer les variance génétique et environnemental pour un trait morphologique (model univarié). Je souhaite à présent calculer les covariance génétique (model bivarié) Corrélation génétique, est ce que quelqu'un sais comment y faire avec pedigreemm ou un...
par Anais Edme
19 Sep 2017, 11:49
Forum : Questions en cours
Sujet : Asreml-R, model bivarie et mesures repetees
Réponses : 0
Vues : 1729

Asreml-R, model bivarie et mesures repetees

Bonjour Est ce que certains d'entre vous connaissent un peu asreml-R ? Je cherche a faire un modele bivarie avec des mesures repetees. J'ai le tuto pour le modele bivarie seul, les measures repetees seules, mais pas les deux combines. Et je ne trouve rien sur internet qui pourrait m'aider. Merci Anais
par Anais Edme
09 Nov 2016, 14:29
Forum : Questions en cours
Sujet : Residuals
Réponses : 2
Vues : 1294

Re: Residuals

Merci Florent,
je m'en doutais un peu mais je voulais etre sur ! Autant ne pas faire de betise
par Anais Edme
09 Nov 2016, 14:20
Forum : Questions en cours
Sujet : Residuals
Réponses : 2
Vues : 1294

Residuals

Bonjour ! J'ai donc un model lineaire mixe. J'en extrait les residuals avec resid(model1). Donc j'ai un jolie vecteur avec tous mes residuals. Mais comment etre sur que la ligne 1 de mes residuals corresponds bien a la ligne 1 du tableau de donnees utiliser pour l'analyse ? Comment demander a R d'aj...
par Anais Edme
13 Oct 2016, 14:25
Forum : Questions en cours
Sujet : MCMCglmm et crash de R
Réponses : 0
Vues : 1872

MCMCglmm et crash de R

Bonjour J'utilise le package MCMCglmm pour calculer l'heritabilite d'un trait. J'ai suivi les instruction du WAMWiki qui marche impec pour me former. Mais des que j'utilise mes donnes ca coince, en effet, R crash des que j'ajoute le pedigree dans mon MCMCglmm. mon ficher data comporte 12000 lignes e...
par Anais Edme
13 Oct 2016, 06:40
Forum : Questions en cours
Sujet : aggregate et NA
Réponses : 2
Vues : 2623

aggregate et NA

Bonjour,

j'utilise la fonction aggregate pour calculer une moynne par annee, mais j'ai des NA donc les moyennes ne se calculent pas et me retournent des NA.
Comment eviter cela ? j'ai ajouter na.action=na.omit mais ca ne marche pas

Merci
par Anais Edme
26 Sep 2016, 14:28
Forum : Questions en cours
Sujet : la taille des axes [resolu]
Réponses : 4
Vues : 2103

Re: la taille des axes

Salut JE Oui je suis sous un plot classique plot(Wave,Natural.Black) pas de ggplot pour le coup et si j'arrive bien a augmenter la taille de la legend de l'axe, ce n'est pas le cas pour l'axe en lui meme. C'est quoi un ecm ? tu sais bien qu'il faut pas me parler en code voyons XD Bonjour Nicolas Mer...
par Anais Edme
29 Aoû 2016, 06:52
Forum : Questions en cours
Sujet : la taille des axes [resolu]
Réponses : 4
Vues : 2103

la taille des axes [resolu]

Bonjour,

je chercher a augmenter la taille des axes (pas la taille de l'ecriture ou des titres, mais bien les lignes de l'axe x et y).
Des idees ?

Merci
par Anais Edme
25 Juil 2016, 07:47
Forum : Questions en cours
Sujet : poly et scatter plot
Réponses : 0
Vues : 1791

poly et scatter plot

Bonjour à tous ! Encore une fois je viens recourir à votre aide pour R. J'ai réalisé des modèle linéaires generalisés (glm) avec la function poly pour un des facteur. lm (A~B+C+D+poly(E,2)). J'ai un joli résultat et j'aurai besoin de faire le graphique avec la courbe pour le terme quadratique de E. ...
par Anais Edme
17 Mar 2016, 09:10
Forum : Questions en cours
Sujet : package effect
Réponses : 0
Vues : 1502

package effect

Bonjour a tous ! J'ai un model lineair du type lm(a~ b+c+d+b*c). avec c une variable categoirel J'utilise le package effect et la fonction allEffect. J'obtiens les valeurs de mes effets pour mon interaction b*c, parfait .... oui mais les effets commencent pour b=110 et finisse a 135 (avec une valeur...
par Anais Edme
01 Mar 2016, 10:57
Forum : Questions en cours
Sujet : Graphique d'une interaction
Réponses : 2
Vues : 1401

Graphique d'une interaction

Bonjour, j'ai un model du type lm(y~x*A), y et x sont continue et A est categoriel. Je souhaiterai faire un graphique representant les droits de x en fonction de chaque A sur un meme graghique. J'ai extrais mes effect avec effect Alleffects, et si je les plots, j'ai un graphique avec mes 3 courbes s...
par Anais Edme
16 Fév 2016, 15:12
Forum : Questions en cours
Sujet : Ordonner les lignes d'une data frame
Réponses : 7
Vues : 2115

Re: Ordonner les lignes d'une data frame

Non, meme en le supprimant le probleme persiste.

Edit : J'ai eteins R et relance mon script et ca marche .... va savoir ....
par Anais Edme
16 Fév 2016, 14:21
Forum : Questions en cours
Sujet : Ordonner les lignes d'une data frame
Réponses : 7
Vues : 2115

Re: Ordonner les lignes d'une data frame

Bonjour J'ai un souci avec la fonction factor pour ordonner mes donnees. Ma ligne de cote est effectsize2$response<-factor(effectsize2$response,levels=c("Mating success","Speed mating","Clutch size ","Egg volume")) Il me remplace certain nom de ligne par NA. E...
par Anais Edme
22 Jan 2016, 09:31
Forum : Questions en cours
Sujet : EVENT/TRIAL syntax
Réponses : 4
Vues : 1570

Re: EVENT/TRIAL syntax

Pardon, je vais donc essayer d'etre plus clair. Mais je suis moi meme un peu perdu... Je dois donc realiser un model, ma variable de reponse est numerique (non binomial) et represente un nombre de reussite. Mais tous les nombres d'essais ne sont pas les memes ( je peux avoir 3 reussites pour 4 essai...
par Anais Edme
20 Jan 2016, 14:44
Forum : Questions en cours
Sujet : EVENT/TRIAL syntax
Réponses : 4
Vues : 1570

EVENT/TRIAL syntax

Bonjour

Est ce que quelqu'un sait quel package ou model utiliser pour analyser des donner du genre EVENT/TRIAL.
Je sais qu'il existe quelque chose comme cela sous SAS, mais je droit touver l'equivalent pour R.

Merci

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