d'accord merci beaucoup ! Je pensais que c'était du R comme c'était un souci de mise en forme de tableau mais si il y a plus simple tant mieux ! merci encore !
Bonjour, Je voudrais savoir si c'est possible de réaliser une AFC avec un tableau de relevés faits sur plusieurs années. Voici un exemple de tableau : num annee Accenteur_mouchet Aigrette_garzette Alouette_des_champs D45 2003 0 0 0 D48 2003 0 0 0 D49 2003 0 0 0 E44 2003 1 0 1 E45 2003 1 0 2 D45 2004...
oui voici le code : > ICE(inf2013, taxa.row=T) [1] 29.9 attr(,"method") [1] "ICE" Avec un tableau que j'ai fait pour la commune anctoville qui est de ce type : X5 X10 X15 X20 X25 X30 Pouledeau 0 0 1 0 0 0 Goelandargente 0 1 0 0 0 0 Pigeonramier 0 1 1 1 1 1 Picvert 1 0 0 0 0 0 Hir...
c'est pas mal, je connaissais pas by. Le problème c'est que si je fais une commune toute seule, par exemple anctoville, j'obtiens 29.9, pas 23 obtenu avec by.
Je dispose d'un data.frame de ce type (j'ai enlevé des lignes entre les deux communes), et j'ai 106 communes comme ça > inf2013 COMMUNE Nomespece X5 X10 X15 X20 X25 X30 1 ANCTOVILLE-SUR-BOSCQ Pouledeau 0 0 1 0 0 0 2 ANCTOVILLE-SUR-BOSCQ Goelandargente 0 1 0 0 0 0 3 ANCTOVILLE-SUR-BOSCQ Pigeonramier ...
Dans ce cas là peut-être ceci : for (i in 1:ncol(talistedepeptidesdebase)){ if(E1[,i]==E2[,i]==E3[,i]==E3[,i]==E5[,i]) listevide=listevide[,+E1[,i]]} Il y a sûrement des erreurs mais je pense que dans l'idée c'est ça, ça te donne une base.
Pour connaître les peptides communs aux 5 échantillons, je dirais faire une boucle for avec un if à l'intérieur. Mais il faudrait d'abord créer une liste de base avec tous les peptides possibles : Pour i va de 1 à la fin de ta liste de base , ajouter un peptide à une liste vide si le peptide est dan...
je suis pas experte mais pour valider la normalité des résidus j'aurais plutôt fait directement un shapiro sur les résidus, à moins que tu aies vraiment besoin de cette figure :
Ah mais oui c'est ça. J'avais juste mal lu l'exemple de l'aide et j'ai appliqué bêtement cette erreur sur tous mes tableaux. Merci beaucoup je n'aurais pas vu cette erreur toute seule (ou alors pas avant un long moment).