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par Pierre Bady
07 Juil 2016, 10:45
Forum : Questions en cours
Sujet : Comment se calcule une régression logistique ?
Réponses : 15
Vues : 2266

Re: Comment se calcule une régression logistique ?

resalut, dsl ... de mon coté, il n'y a pas vraiment de soucis ... tab <- structure(list(Hours = c(0.5, 0.75, 1, 1.25, 1.5, 1.75, 1.75,2, 2.25, 2.5, 2.75, 3, 3.25, 3.5, 4, 4.25, 4.5, 4.75, 5, 5.5), Pass = c(0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 1,1, 1, 1, 1)), .Names = c("Hours", &qu...
par Pierre Bady
07 Juil 2016, 07:58
Forum : Questions en cours
Sujet : Comment se calcule une régression logistique ?
Réponses : 15
Vues : 2266

Re: Comment se calcule une régression logistique ?

hello, il s'agit d'une fonction wrapper qui fait appel à dqrls (en fortran) qui fait appel à des routines linpack (dqrdc et dqrsl) pour utiliser la décomposition QR pour résoudre x * b = y ... (voir: https://svn.r-project.org/R/trunk/src/appl/dqrls.f et lm.c dans le include du package stats). Mais l...
par Pierre Bady
05 Juil 2016, 09:41
Forum : Questions en cours
Sujet : Comment se calcule une régression logistique ?
Réponses : 15
Vues : 2266

Re: Comment se calcule une régression logistique ?

Bien le bonjour, un petit doc intéressant (mon premier contacte avec R et la régression logistique :D): - http://pbil.univ-lyon1.fr/R/pdf/br5.pdf quelques traces de notre passé ... version à la paluche ... la convergence est assez rapide :D #----------------------------- # course on glm # from estev...
par Pierre Bady
30 Mar 2016, 13:46
Forum : Questions en cours
Sujet : Optimisation de calculs, appel à contributions
Réponses : 14
Vues : 858

Re: Optimisation de calculs, appel à contributions

Hello, la version de la librairie BLAS utilisée (e.g. openblas, MKL) a aussi une incidence sur le calcul matriciel. Sur certaines opérations, ça fait des grosses différences (http://forums.cirad.fr/logiciel-R/viewtopic.php?f=3&t=7023&p=32742#p32742). bon, j'avoue qu'un truc qui tourne pas tr...
par Pierre Bady
28 Jan 2016, 17:17
Forum : Questions en cours
Sujet : Co-inertie sur deux AFC
Réponses : 7
Vues : 870

Re: Co-inertie sur deux AFC

Hello, il faut faire attention avec made4. On peut faire des COA sur des nombres negatifs avec la fonction ord :) Pour une coinertie entre deux COA voir le package cocorresp On peut également calculer un poid moyenne des lignes basées sur les deux COA, et le réimposer aux deux analyses. il me semble...
par Pierre Bady
11 Jan 2016, 09:53
Forum : Questions en cours
Sujet : ACP des rangs
Réponses : 6
Vues : 1159

Re: ACP des rangs

Bonjour,

Sur des rangs, une ACP sur matrice de covariance (centrée, non-normée) peut être judicieuse.

hth

pierre
par Pierre Bady
07 Sep 2015, 11:29
Forum : Questions en cours
Sujet : R fait-il du parallèle automatiquement ?
Réponses : 9
Vues : 1075

Re: R fait-il du parallèle automatiquement ?

Bonjour, ça peut dépendre des librairies BLAS et LAPACK utilisées. Il me semble que Revolution utilise les versions/implémentations/remaniements proposées par Intel (MKL, https://software.intel.com/en-us/intel-mkl). Un certain nombre d'operations/functions sont implicitement multithreadées. On obser...
par Pierre Bady
01 Juin 2015, 13:52
Forum : Questions en cours
Sujet : [Résolu] Rccp problème de compilation
Réponses : 5
Vues : 1248

Rebonjour, P.S : c'est sur mais si ça peut aller plus vite, changement de boutique, changement de matos et pas dans le bon sens :-( faut que tu me racontes ça, plus en détail! => mail :) * Par contre, il faut quand même faire un peu attention avec le Rcpp, voir ci-dessous: http://www.r-bloggers.com/...
par Pierre Bady
01 Juin 2015, 12:23
Forum : Questions en cours
Sujet : [Résolu] Rccp problème de compilation
Réponses : 5
Vues : 1248

Hello :D il faut peut-être checker tes variables d'environnement, afin d'être sûr que tout ce qui doit être disponible est référencé (PATH vers le compilateur, R_LIBS, etc...), voir le message d'erreur en dessous Compilation ERROR, function(s)/method(s) not created! g++: not found j'ai testé avec ub...
par Pierre Bady
24 Fév 2015, 09:06
Forum : Questions en cours
Sujet : Les limites de R : Big Data
Réponses : 6
Vues : 3679

par Pierre Bady
19 Fév 2015, 15:29
Forum : Questions en cours
Sujet : GLM avec données bornées
Réponses : 2
Vues : 1065

bonjour,

tu peux jeter un coup d'oeil du coté de la function survreg du package survival pour faire de la régression avec censure (e.g. tobit and co). Il existe peut-être (maintenant) un package spécifique pour faire ceci (?)

HTH

@+

pierre
par Pierre Bady
11 Fév 2015, 13:37
Forum : Questions en cours
Sujet : sites web anglophones sur R
Réponses : 7
Vues : 1049

hello,

une bonne base multi-langage :)
http://www.r-project.org/other-docs.html
http://cran.r-project.org/other-docs.html

sinon, il y a aussi:
http://www.statmethods.net/



HTH


pierre
par Pierre Bady
14 Jan 2015, 09:18
Forum : Questions en cours
Sujet : comment faire tourner des scripts R sur un réseau de PC?
Réponses : 10
Vues : 2355

Hello, lors de la parallélisation, il faut quand même faire attention à quelques petites choses. - Ne pas confondre cores et threads. Le multithreading est cool, mais c'est généralement + 20% en perf. - Avoir suffisamment de mémoire pour alimenter les CPUs et pour gérer efficacement le partage des d...
par Pierre Bady
14 Jan 2015, 09:12
Forum : Questions en cours
Sujet : [collaboratif] For faster R
Réponses : 0
Vues : 950

[collaboratif] For faster R

Bien le bonjour, Voici juste quelques notes (en mode ultra-draft) de travail et un début de liste de liens au sujet de l'utilisation des library BLAS & co pour/avec R. si ça peut aider, c'est cool ... sinon, ben c'est pas grave :D @++ et bonne journée, pierre For faster R use OpenBLAS For faster...
par Pierre Bady
05 Mar 2014, 13:35
Forum : Questions en cours
Sujet : Calcul d'une moyenne de plusieurs matrices
Réponses : 9
Vues : 5465

bien le bonjour, la function Reduce peut également rendre quelques services lorsque l'on travaille sur des listes :) xx <- NULL for(i in 1:10) xx[[i]] <- matrix(c(1,2,3,4),nc=2) Reduce("+",xx) Reduce("+",xx)/length(xx) HTH pierre

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