Bonjour, Je cherche à faire deux graphique dans le même dev. (un png par exemple) mais avec deux graphique dessus (mfrow) et pour faire plaisir à la DDT, le premier fait 10cm de large et le second 5cm, tout deux avec 10 cm de haut… pour info, le premier contiendra une carte d'Islande, et le second u...
Bonjour, J'ai crée un un paquetage perso ( https://github.com/giby/Linarius ) que vu les fonctions présentes, je ne veut pas mettre en licence "Libre" selon la définition classique. J'ai donc fait une licence perso basé sur la licence JSON. Comment faire pour avoir un warning au lancement ...
Bonjour, Je dispose de plusieurs objet de classe "phylo" et je veut les mettre en graph . Je souhaite colorer les branches et nœuds interne quand/si tout ce qui e trouve au delà du nœud appartient au même groupe de coloration, et tout ce qui coresponds à des clades mélangés soit par exempl...
oui, c'est plus "général" que l'exemple donné… puisque biensur je veut le mettre dans une fonction pour générer une matrice binaire… Pret pour la migraine? Alors là ou j'ai une valeure fixe, en fait je vais mettre la sortie d'une autre commende perso qui la me donne ça: frec[,4] al90 al93 ...
Bon, ça ne teste JAMAIS les moyennes, toujours les médiane Le premier que tu cites: U de mann-withney wilcoxon, c'est deux groupes indépendants … le seconds T de Wilcoxon, les deux mesures sont appareillé donc corespondent au même individu… ça peut être deux mesures à deux moment différants ou deux ...
Le Mann-kendall est si je ne m'abuse le test non parametrique qui sert à voir si il y a une liaison entre deux variable en comparant les classement, ce test est du à Kendall qui a adapté le Mann-Whitney au cas des corrélations…
Bonjour, J'essaye d'évalué la relation entre deux variables appareillées à distribution non-normal. Pour celà j'utilise le test de Kendall pour les corrélations. library(Kendall) > Kendall(as.vector(gpsdist),as.vector(distJ)) tau = 0.0646, 2-sided pvalue =< 2.22e-16 >...
Salut, J'ai fait pas mal de carte sous R, je te conseillerais de le pas utiliser map() qui ne m'a pas donné satisfaction avec maptools, tu as bien assez si tu as des bonnes cartes en memoire (avec une meilleur résolution que map() ) http://www.diva-gis.org/datadown http://spatialanalysis.co.uk/ te d...
Alors merci pour vos réponses … Alors, en m'inspirant des deux, j'ai produit ce code: type <- c("fan", "unroot") methodesD<-c("jaccard","cao") methodesC<-c("average","complete") color<-c(code$popcol,code$Ploidy,c...
Bonjour, En ce moment je produit pas mal de graph tous similaire: distJ=vegdist(gel, method="jaccard", binary=TRUE, diag=FALSE, upper=FALSE, na.rm = FALSE) dendro=hclust(distJ,method = "average") png(file="Graph/Betula_fan-J-UPGMA-Pop.png",width = 10...
Oui, j'avais bien vu mais il faut peut-être le spécifier à la fonction amova. Si je comprends bien, vous produisez une matrice de distance entre les individus mais le niveau population n'est pas spécifié dans cette matrice si ? Bon mais je ne connais pas les entrées attendues par la fonction. Regar...
Ok mais je pose la question parce que les intitulés de lignes du tableau de génotypage avec les 0 et les 1 ne correspondent pas au niveaux contenus dans la colonne CpH. Je me demandais donc si les données de distances étaient bien au bon format... La dernière lettre du nom de chaque ligne corespond...