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par Maxime Hervé
06 Avr 2016, 11:39
Forum : Questions en cours
Sujet : Réalisation d'une ACC [Résolu]
Réponses : 2
Vues : 619

Re: Réalisation d'une ACC

Bonjour,

vous pouvez utiliser la fonction CCorA() du package vegan. Regardez l'aide, ça devrait être très simple à mettre en place.

Maxime
par Maxime Hervé
06 Jan 2016, 07:08
Forum : Questions en cours
Sujet : Messages d'erreur en modèles multinomiaux
Réponses : 4
Vues : 1630

Re: Messages d'erreur en modèles multinomiaux

Bonjour,

clmm2() est une ancienne fonction, la première qui permettait de faire du modèle mixte et seulement avec un facteur aléatoire. Préférez clmm() qui est plus intéressante, et utilise la syntaxe 'classique' (1|F). C'est la même chose avec clm() qu'il faut préférer à clm2().

Maxime
par Maxime Hervé
11 Nov 2015, 16:06
Forum : Questions en cours
Sujet : Afficher les p-value de lm() sur un graphe
Réponses : 2
Vues : 1604

Re: Afficher les p-value de lm() sur un graphe

Bonjour, les p-values sont dans le tableau 'coefficients', accessible de cette façon : summary(lin)$coefficients Ce qui est retourné est une matrice, donc vous pouvez vous ballader dedans comme dans n'importe quelle matrice. La colonne des p-values est ainsi : summary(lm.D9)$coefficients[,"Pr(>...
par Maxime Hervé
02 Nov 2015, 15:06
Forum : Questions en cours
Sujet : legend() : taille du texte et du cadre
Réponses : 3
Vues : 10760

Re: legend() : taille du texte et du cadre

Bonjour,

j'ai pas bien compris non plus, mais la solution la plus simple ne serait pas de virer le cadre ? Pour ça il y a bty="n".

Maxime
par Maxime Hervé
25 Sep 2015, 09:51
Forum : Questions en cours
Sujet : Décomposition d'une interaction (2 facteurs inter et 1 facteur intra)
Réponses : 6
Vues : 1563

Re: Décomposition d'une interaction (2 facteurs inter et 1 facteur intra)

lsmeans vous donnera des comparaisons multiples, pas l'effet global d'un terme du modèle. Vous devez créer plusieurs modèles (1 par modalité) de C, et dans votre cas tester l'interaction A:B de chacun de ces modèles via aov_ez (que je ne connais pas).

Cordialement,

Maxime
par Maxime Hervé
24 Sep 2015, 17:19
Forum : Questions en cours
Sujet : Décomposition d'une interaction (2 facteurs inter et 1 facteur intra)
Réponses : 6
Vues : 1563

Re: Décomposition d'une interaction (2 facteurs inter et 1 facteur intra)

Bonjour, je ne comprends pas bien ce que vous cherchez à obtenir : une p-value de l'effet de l'interaction A*B pour chaque modalité de C, ou des comparaisons multiples de toutes les combinaisons de A et B pour chaque modalité de C ? Dans le premier cas je dirais un modèle par modalité de C, dans le ...
par Maxime Hervé
28 Juil 2015, 09:33
Forum : Questions en cours
Sujet : UTILISATION DE OUTLIER
Réponses : 1
Vues : 696

Re: UTILISATION DE OUTLIER

Bonjour,

Code : Tout sélectionner

example(grubbs.test)

Maxime
par Maxime Hervé
05 Juin 2015, 10:58
Forum : Questions en cours
Sujet : Kudos !
Réponses : 8
Vues : 1443

Re: Kudos !

Histoire de ne pas se répéter : pareillement !
par Maxime Hervé
05 Juin 2015, 06:49
Forum : Questions en cours
Sujet : Test de Tukey avec les fonctions lsmeans ou cld et glht
Réponses : 6
Vues : 4646

Re: Test de Tukey avec les fonctions lsmeans ou cld et glht

Bonjour, il n'y a aucun problème à faire des comparaisons sur un terme d'interaction avec lsmeans(). Sur le même modèle qu'Eric : mod <- glm(activite~station*suivi*tranche_heure,data=molosse,family=poisson,epsilon=1e-3,maxit=1000,trace=F) J'ai le même résultat avec cld(lsmeans(mod,~suivi:station)) e...
par Maxime Hervé
28 Mai 2015, 09:29
Forum : Questions en cours
Sujet : [resolu] organiser les données d'une liste en un vecteur
Réponses : 5
Vues : 1151

Ou unlist si on n'a pas envie de se frotter au do.call !

Code : Tout sélectionner

> maListe <- list(1:0, 0, 0, 1:0, 3:0, 0)
> unlist(maListe)
 [1] 1 0 0 0 1 0 3 2 1 0 0

Maxime
par Maxime Hervé
22 Mai 2015, 12:41
Forum : Questions en cours
Sujet : Analyse discriminante fonctions "lda" et "DA.
Réponses : 1
Vues : 1265

Bonjour, trois commentaires : 1. Oui vous avez bien compris le principe de la procédure. 2. Votre 3ème ligne de commande n'a pas de sens. Dans le tableau renvoyé par la fonction DA.valid, vous avez une ligne par axe de l'analyse et le % d'erreur de classification moyen en prenant en compte les axes ...
par Maxime Hervé
20 Avr 2015, 08:56
Forum : Questions en cours
Sujet : [resolu] problem sortie glmer
Réponses : 2
Vues : 1094

Bonjour, Les deux machines ont des version de R différentes, la première est en 2.14.1, la seconde en 3.0.2. Serait-ce là l'explication ? Pour moi oui, clairement. Avec une versions de R 2.x.x tu n'as pas accès aux version 1.x.x de lme4. Or dans la version 1.0.0 du package de grosses modifications o...
par Maxime Hervé
13 Avr 2015, 14:43
Forum : Questions en cours
Sujet : test sur le rang : comparaison de plus de 2 échantillons
Réponses : 2
Vues : 1674

Bonjour,

je suis désolé mais vous ne flirtez pas avec les limites de ce forum, vous les avez franchies :)

Mais histoire de ne pas vous laisser sans piste, regardez donc du côté de la régression logistique (GLM pour données binaires).

Maxime
par Maxime Hervé
13 Avr 2015, 05:17
Forum : Questions en cours
Sujet : courbes de survie, Kaplan-Meier
Réponses : 2
Vues : 1595

Bonjour, si c'est ce que je pense, ça n'a aucun rapport avec ce type de graphe en particulier. Il y a toujours un décalage de 4 % entre la valeur minimale dans les données et la valeur minimale d'un axe (idem avec le maximum), c'est un paramètre graphique général destiné à améliorer la visibilité de...
par Maxime Hervé
03 Avr 2015, 14:54
Forum : Questions en cours
Sujet : barres d'erreurs dans barplot empilé
Réponses : 2
Vues : 932

Bonjour, sachant que vos moyennes et barres d'erreur doivent être dans des matrices, voilà une solution simple : (moy <- matrix(runif(12,10,20),ncol=4,dimnames=list(letters[1:3],LETTERS[1:4]))) (es <- matrix(rnorm(12,1,0.3),ncol=4,dimnames=list(let...

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