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par Stéphane Adamowicz
11 Juin 2012, 08:40
Forum : Questions en cours
Sujet : programmer une fonction avec argument "subset" [Ré
Réponses : 20
Vues : 10854

Oui, j'avais essayé de donner une valeur NULL par défaut à "subset", mais on a alors le message d'erreur suivant :
Erreur dans xj[i] : type 'closure' d'indice incorrect
par Stéphane Adamowicz
11 Juin 2012, 07:19
Forum : Questions en cours
Sujet : programmer une fonction avec argument "subset" [Ré
Réponses : 20
Vues : 10854

Merci de la suggestion, mais ce nouveau code produit l'erreur suivante lorsqu'on utilise l'argument "subset" : > (myTable <- tablestat(len ~ supp + dose, data=ToothGrowth, subset=dose>0.5, FUN= alist(mean, median, sd, coefvar))) Erreur dans eval(expr, envir, enclos) : ..1 utilisé dans un m...
par Stéphane Adamowicz
08 Juin 2012, 16:00
Forum : Questions en cours
Sujet : programmer une fonction avec argument "subset" [Ré
Réponses : 20
Vues : 10854

Merci beaucoup pour la suggestion, mais cela ne semble pas produire l'effet attendu. Voici le nouveau code: tablestat <- function(formula, data= Data, FUN= alist(min, mean, median, max, var, sd, coefvar, sem, confint), prob= 0.95, ...) { TABLE <- aggregate(formula, data, sub...
par Stéphane Adamowicz
08 Juin 2012, 09:32
Forum : Questions en cours
Sujet : programmer une fonction avec argument "subset" [Ré
Réponses : 20
Vues : 10854

programmer une fonction avec argument "subset" [Ré

Voici ci-dessous une fonction qui permet de créer facilement un Dataframe contenant un résumé statistique d'une variable (noter que les arguments "coefvar", "sem" et "confint" désignent respectivement le coefficient de variation en %, l'erreur standard de la moyenne et ...
par Stéphane Adamowicz
15 Mar 2012, 11:57
Forum : Questions en cours
Sujet : Analyse de variance mixte: pas d'alternative à aov ?
Réponses : 15
Vues : 5577

Oui, d'accord ... Enfin, je ne sais plus si nous sommes d'accord ou non ! Dans mon message initial, j'écrivais que les Plantes sont nichées dans les Nutritions, puisque chaque plante n'est affectée qu'à une seule Nutrition. Ce me semble correspondre à la définition du grand homme. Mais il commence p...
par Stéphane Adamowicz
15 Mar 2012, 10:22
Forum : Questions en cours
Sujet : Analyse de variance mixte: pas d'alternative à aov ?
Réponses : 15
Vues : 5577

Merci beaucoup de prendre le temps de réfléchir à ce type de problème. N'étant pas non plus ce qu'on peut appeler un spécialiste, je me suis aussi posé ce genre de question, et j'ai aussi des doutes sur le vocabulaire qu'il convient d'utiliser. Je ne suis sûr que de deux choses: 1) du statut des fac...
par Stéphane Adamowicz
14 Mar 2012, 08:09
Forum : Questions en cours
Sujet : Analyse de variance mixte: pas d'alternative à aov ?
Réponses : 15
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réponse à Stéphane Laurent

La nécessité des deux termes d'erreur tient à ceci : 1) Les nutritions sont aléatoirement distribuées sur les plants. Le facteur Nutrition se teste naturellement par rapport à la variabilité entre plants sachant la nutrition ; 2) En revanche, l'interaction Organe x Nutrition n'est pas aléatoirement ...
par Stéphane Adamowicz
13 Mar 2012, 12:41
Forum : Questions en cours
Sujet : Analyse de variance mixte: pas d'alternative à aov ?
Réponses : 15
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réponse à Maxime Hervé

Merci pour cette suggestion dont voici le résultat: > anova(lmer(Saccharose.pc~Nutrition*Organe + (1|Nutrition/Plant), data=Data)) Analysis of Variance Table Df Sum Sq Mean Sq F value Nutrition 3 0.211487 0.070496 10.3755 Organe 2 0.014504 0.007252 1.0673 Nutrition:Organe 6 0...
par Stéphane Adamowicz
13 Mar 2012, 12:21
Forum : Questions en cours
Sujet : Analyse de variance mixte: pas d'alternative à aov ?
Réponses : 15
Vues : 5577

réponse à Éric

Certes, Éric, mais tout dépend de ce qu'on entend par syntaxe équivalente. Il semble que tu considères qu'elles le sont parce qu'elles font la même décomposition des SCE. Mais on n'a pas besoin d'un terme Error() pour cela. Ensuite, on a toujours la ressource de terminer une analyse à la main ... L'...
par Stéphane Adamowicz
13 Mar 2012, 09:25
Forum : Questions en cours
Sujet : Analyse de variance mixte: pas d'alternative à aov ?
Réponses : 15
Vues : 5577

réponse à Eric et Stéphane

Désolé de n'être d'accord avec aucun de vous: aucune de ces écritures n'est équivalente à: ( summary( aov(Saccharose.~Nutrition*Organe + Error(Plant%in%Nutrition), data=Data))) Error: Plant:Nutrition Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F) Nutrition 3 0.7754 0.25847 ...
par Stéphane Adamowicz
12 Mar 2012, 09:17
Forum : Questions en cours
Sujet : Analyse de variance mixte: pas d'alternative à aov ?
Réponses : 15
Vues : 5577

Analyse de variance mixte: pas d'alternative à aov ?

Lorsqu'une analyse de variance comporte plusieurs termes d'erreurs, il est nécessaire de les modéliser et R semble proposer diverses solutions. Malheureusement, elles sont très pauvrement documentées pour le simple utilisateur que je suis. Si j'ai bien compris, la fonction aov() propose deux syntaxe...

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