Groupe des utilisateurs du logiciel R

Bonjour à tous, j'ai besoin de faire un graphe où 22 courbes (1 courbe par jour d'analyse) seront représentées. Je souhaite attribuer 1 couleur à chaque courbes mais je ne sais pas comment faire car les palettes que j'ai trouvées ne comportent que 12 couleurs au maximum. Il me faudrait donc : - soit...

Merci Mickael.

Merci Serge
je vais regarder.
Bonne journée

Bonjour, oui, tu as raison ... mais beaucoup d'utilisateurs biologistes utilisent R pour des analyses transcriptomiques et je sais que pour ces analyses on a accès aux termes GO. Le hic est que je n'y connais rien dans ces analyses. Je compte donc sur un habitué des analyses de RNAseq pour me donner...

Bonjour à tous, J'ai une liste assez conséquente de gènes avec : leur Symbole, le GeneID et l'Accession Number. Je souhaiterais associer à ces gènes leur n° GO ainsi que GO:biological process, GO:molecular function et GO:cellular component. Est-il possible de faire cela avec R ? Si oui, comment ? Un...

Merci Mickael, je vais étudier tout ça.
Patricia

Merci François, je vais étudier ces pistes.
Bonne journée
Patricia

Bonjour je souhaiterais savoir s'il est possible avec ggplot2 de réaliser des graphiques avec deux axes Y. J'ai 8 traitements avec des mesures sur 4 jours. Je m'intéresse au nombre de cellules d'une part et d'autre part aux cellules qui expriment un marqueur spécifique. Je voudrais représenter sur l...

Super !
C'est exactement ce que je cherchais à faire.
Merci beaucoup Maxime.
Bonne journée !
Patricia

Bonjour à tous j'utilise ggplot pour faire une représentation graphique de l'effets de plusieurs traitements au cours du temps. Dans mon exemple j'obtiens 8 courbes : 4 sont obtenues en présence d'antibiotique et 4 sans. Je souhaiterais que les 4 courbes avec antibiotique apparaissent avec un dégrad...

Merci Pierre-Yves, J'obtiens bien des points mais les 4 graphiques sont identiques .. ;-( Voici le dataframe corrigé : plate <- structure(list(Cond = structure(1:28, .Label = c("j1_05_woATB", "j1_10_woATB", "j1_20_woATB", "j1_50_woATB", "j2_05_ATB", ...

Bonjour à tous, je souhaite tracer plusieurs plots sur une même page mais je rencontre plusieurs problèmes. J'ai plusieurs conditions "Trait1" pour lesquelles je voudrais voir apparaître le nuage de points des "nCells" en fonction de "day". L'idée serait ensuite de mett...

Bonjour, je cherche comment écrire le calcul du t.test, la récupération de la pvalue et le tracé d'un barplot pour plus de deux échantillons. Il me faut écrire une boucle pour appliquer sur plus de 15 échantillons ce que je faisais sur mon échantillon seul. Voici le script que j'utilise pour un écha...

Toutes mes excuses Pierre-Yves, ça correspond exactement à ce que je veux. J'avais mal anticipé ce que donnerait ta 1ère ligne de code "moy_NY"... C'est la deuxième partie de l'expression qui me déroute : DeltaCt ~ TheGene. Peux tu expliciter le "~" s'il te plait ? Merci beaucoup...

Bonsoir Pierre-Yves je n'ai pas eu le temps de tester ta solution ce soir mais je crois que ça ne correspond pas tout à fait à ce que je souhaite. Dans l'exemple joint à mon message, il y a 2 gènes différents. Je souhaite calculer le Delta Ct Moyen du traitement NT de chaque gène (et pas la moyenne ...