bonjour, j'ai peut-être loupé un épisode, mais as-tu regardé du coté de nlme et lme4? Pour les modèles mixtes, ces deux packages sont sévèrement efficace. En plus leur documentation est plutôt bien fournie. sinon, pour ta binomiale negative continue ... une gamma ou un log-normale ne pourraient pas ...
bonjour, aucune idée, mais on peut le programmer facilement et utiliser les fonctions du package ade4 pour mettre cela en forme. il faut faire attention car, les coefficients de correlation sont signés. Pour prendre en compte cela, on a deux solutions: * transformation des données: abs(x) ou x^2 (&q...
bonjour, la modification des argument de la function hclust dans heatmap est assez simple à mettre en oeuvre: # example: x <- as.matrix(mtcars) hv <- heatmap(x,col=topo.colors(256)) hv <- heatmap(x,col=topo.colors(256),hclustfun=function(x)hclust(x,met...
bonjour, Je voulais savoir d'abord si mes jeux de données sont bien (sachant que je n'aurai les résultats en août je m'avance pour préparer mes tableaux) et s'il existe une commande sous R permettant de faire l'ACP d'un simple clic :) Arghhh !!!! ... ça fait mal les clics :( Etant plutôt un utilisat...
hello, juste mon petit grain de sel ... d'une part il faut toujours utiliser l'argument data dans le glm le terme 'toujours' me semble être un peu fort ... Si tu bosses sur des très gros jeux de données (ex. GWAS avec des données de SNPs), ça peut même devenir toxique :) HTH @+ pierre
pour évaluer la colinéarité ou la multi-colinéarité dans un modèle de régression, les valeurs de VIF (variance inflated factor, voir par exemple le package car) sont (très) utiles. c'est d'ailleurs fait pour.
bonjour, juste pour info, avez-vous vérifier si l'argument 'intercept' existe pour la fonction 'glm' ? l'argument 'intercept' est utilisé dans la fonction glm.fit. Il s'agit d'une fonction plus bas niveau qui est utilise en interne dans la fonction glm. En principe, on utilise la fonction glm. pour ...
bonjour, newdata=cbind(doubs[,c(12:38)],das,alt,pen,deb,pH,dur,pho,nit,amm,oxy,dbo) doubs[,c(12:38)] ... ça ressemble à quoi ? une matrice?, un data.frame? les variables sont des 'numerics', des 'characters', des 'factors'? si vous travailler avec des data.frames utiliser les commandes suivant pour ...