Messagepar Renaud Lancelot » 18 Mai 2005, 07:04
Bonjour,
En complément de la réponse de Manu:
1. Le package lme4, très activement développé par Douglas Bates (un des auteurs du package nlme et du bouquin cité par Manu), devrait remplacer à terme le package nlme. Il est censé être plus flexible dans la spécification des effets aléatoires, plus rapide et plus précis dans ses résultats.
2. Le package SASmixed (D. Bates également) contient des jeux de données et des exemples d'analyses parallèles SAS / lmer (la fct équivalente à lme dans le package lme4).
3. Le package mlmRev (encore D. Bates) contient des exemples classiques d'analyses "multilevel" souvent reprises dans les logiciels comme MLwiN, HLM ou SAS.
4. Un excellent bouquin pour les données répétées est celui de Diggle, Liang et Zeger:
Diggle, P.J., Liang, K.-Y., Zeger, S.L., 1994. Analysis of longitudinal data. Oxford (UK), Clarendon Press, 253 p.
dont il y a d'ailleurs une édition plus récente (2002, je crois). Il présente une panoplie de méthodes plus large que celles dispo dans nlme / lme4, notamment les très classiques modèles GEE, disponibles dans plusieurs packages (e.g., yags et geepack). Ce livre contient des exemples d'analyses de croissance des arbres, et les jeux de données sont dispo dans nlme (e.g., Spruce).
Cordialement,
Renaud