ACP sur rang de Spearman

[Antigone Uzunidis]

Bonjour,

Je suis une utilisatrice basique de R.
J'aimerai réaliser une ACP sur rang de Spearman parce que mes données sont très inégales entre elles.
Je ne suis pas sure de la démarche à suivre.
Pour l'instant mon code ressemble à ça :

spearman_BD_ACP_CERVMOY <- cor(x = BD_ACP_CERVMOY,method = "spearman")
res11a <- PCA(spearman_BD_ACP_CERVMOY, scale.unit = TRUE, graph = FALSE)

Je ne suis pas sûre du tout de moi. Quelqu'un pourrait m'éclairer ?

Merci d'avance !

[Eric Wajnberg]

Bonjour,

Je suis une utilisatrice basique de R.
J'aimerai réaliser une ACP sur rang de Spearman parce que mes données sont très inégales entre elles.
Je ne suis pas sure de la démarche à suivre.
Pour l'instant mon code ressemble à ça :

spearman_BD_ACP_CERVMOY <- cor(x = BD_ACP_CERVMOY,method = "spearman")
res11a <- PCA(spearman_BD_ACP_CERVMOY, scale.unit = TRUE, graph = FALSE)

Je ne suis pas sûre du tout de moi. Quelqu'un pourrait m'éclairer ?

Merci d'avance !

Votre code n'est pas standard :

Code : Tout sélectionner

> PCA
Error: object 'PCA' not found

On ne peut vous aider (notamment, quelle est la syntaxe de cette fonction PCA() ?).

Eric.

[Antigone Uzunidis]

Merci pour votre réponse.

La fonction pca vient du package factomineR. C'est avec celui-ci que je tente de faire cette ACP sur rang. Seulement, comme ade4, le package factormineR ne permet de faire des ACP qu'à partir de matrice de Pearson.

[Eric Wajnberg]

Ok.

Une rechercher rapide sur google indique qu'il y a une fonction PCA() dans le package EFA.dimensions qui fait une acp à partir d'une matrice de corrélation de Spearman. Voir https://search.r-project.org/CRAN/refmans/EFA.dimensions/html/PCA.html.

HTH, Eric.