question sur boxplot

[Couanais Pierre]

Bonjour à tous,

Je souhaite faire un boxplot de vecteurs de données, tout en enlevant les valeurs aberrantes... Mais comment trouver ces dernières? En enlevant les res$out? Ou en enlevant celles supérieurs à 2 fois l'ecart type?

Merci d'avance

[Nicolas Péru]

je ne sais pas si ça va vous aider mais dans boxplot on trouve l'option "outline" que l'on peut passer à FALSE pour ne pas afficher les outliers.
Dans ce cas l'axe garde cependant la même échelle que si on fait apparaitre les outliers. Il suffit alors de jouer sur le paramètre ylim pour supprimer le problème.

Nicolas

[Logez Maxime]

Re,

veux-tu représenter tes données mais sans faire afficher les outliers ? ou veux-tu enlever les outliers du calcul et ensuite représenter les données ? Ce n'est pas la même chose, les représentations graphiques ne seront pas les mêmes.

Si tu veux juste les omettre de la représentation graphique :

Code : Tout sélectionner

y <- rnorm(100)
x <- gl(5,20)
y[sample(1:100,5)] <- 20
boxplot(y~x,ylim=range(boxplot(y~x,plot=FALSE)$stats),outline =FALSE)

# a comparer avec
boxplot(y~x)

Maxime

[Couanais Pierre]

Merci à tous les 2 de votre réponse! Oui je me suis aperçu que ce n'était pas la même chose Maxime. Que vaut il mieux faire alors? Les enlever complétement ou juste ne pas les représenter graphiquement selon vous ?

[Couanais Pierre]

Et d'ailleurs, question supplémentaire désolé, comment sont calculés les outliers ?

Merci d'avance

[Logez Maxime]

Re,

Pour la première question c'est a toi de voir. Perso je suis assez d'accord avec la remarque de Renaud dans un de ces précédents posts disant que si tu les enlèves de la représentation tu perds de l'information quand à la vrai nature de ta distribution.

Pour la deuxième question :
?boxplot.stats

Maxime

[Nicolas Péru]

Moi en général je réponds que ça dépend de l'originie des outliers. Dans le cas de mesure de dimension par exemple si on mesure un objet qui sort de l'ordinaire on peut s'attendre à ce que cela donne un outlier. A ce moment là il ne parait pas inutile de supprimer la mesure en question.
Dans le doute on garde les outliers si aucune précision ne peut aider à connaitre leur origine.

Nicolas

[Couanais Pierre]

Merci bien pour tout!