Accélérer rbind

[Laëtitia VIBERT]

Re-bonjour,

Question qui fait suite à ma question préalable, j'ai besoin dans mon script de filtrer mes données afin de supprimer celles qui sont hors de la zone d'étude.
Pour ne pas les supprimer complètement, j'ai d'abord copié dans un autre df toutes les lignes dont les coordonnées sont hors de la zone d'étude, en utilisant

Code : Tout sélectionner

if

et

Code : Tout sélectionner

rbind()

Néanmoins, cette méthode demande énormément de temps, et je me demandais s'il y avait un trick pour effectuer la même chose plus rapidement...

En vous remerciant pour votre aide

Laëtitia

[Mickael Canouil]

Voir viewtopic.php?f=3&t=10049

[Matthieu Lesnoff]

de manière générale, éviter rbind dès qu'il y a beaucoup d'itérations
Préférer "rbindlist" (très rapide) du package data.table (qu'il faut installer)

n <- 3 ; p <- 5 ; nrep <- 4

# List of data.frames
mylist <- lapply(1:nrep, function(x) as.data.frame(matrix(runif(n * p), nrow = n)))

# transformation of the data.frames in data.table format
mylist.dt <- lapply(mylist, data.table)

res <- as.data.frame(rbindlist(ldt))
res

[camille garcin]

Pourquoi ne pas utiliser subset, qui permet, comme son nom l'indique, d'extraire un sous ensemble d'un data frame ?

Code : Tout sélectionner

df_hors_zone<-subset(df, conditions...)