représentation graphique des corrélations suite à une ACP contrainte

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Augustin Soulard
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représentation graphique des corrélations suite à une ACP contrainte

Messagepar Augustin Soulard » 10 Juil 2020, 08:17

Je voudrais réaliser une ACP contrainte et représenter des corrélations entre densité d'espèces sur 2 sites. Typiquement, je veux faire ce qui est affiché sur cette image. Savez-vous comment réaliser le graphique à droite ?
(Je n'arrive pas à faire afficher l'image, donc voici un lien vers mon drive, c'est safe ;))
https://drive.google.com/file/d/1kR98TZV1THQvXEe35ysqzoF46lYs8OVN/view?usp=sharing

Bonne journée,

Maxime Hervé
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Re: représentation graphique des corrélations suite à une ACP contrainte

Messagepar Maxime Hervé » 10 Juil 2020, 13:57

Bonjour Augustin,

si ton ACP contrainte (ta RDA, quoi) a été réalisée avec le package vegan ou avec ade4, tu dois pouvoir faire avec le package RVAideMemoire. Quelque chose du genre :

Code : Tout sélectionner

MVA.plot(ta_RDA,"corr",xax=1,yax=NULL)

à peaufiner ensuite.

Cordialement,

Maxime

Augustin Soulard
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Re: représentation graphique des corrélations suite à une ACP contrainte

Messagepar Augustin Soulard » 16 Juil 2020, 09:31

Super ! Merci beaucoup :)


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