Sélection de GAMM et effets aléatoires

[Margaux LEFEVRE]

Bonjours à tous et à toutes,

Je suis en Master 2 et je suis débutante avec les modèles additifs généralisées / à effets mixtes (GAM / GAMM).

J'aurais 2/3 questions :

Est-ce que la sélection des variables passe par un "select = T" et est-ce que cela équivaut à une sélection de modèle ?

Est-ce que pour mettre un facteur en aléatoire la syntaxe est comme ceci : s(fac, bs="re") ?

Je vous remercie de votre aide !

Belle journée,

Margaux

[Facundo Muñoz]

Bonjour Margaux,

Il faut préciser quel package et quelles fonctions concernent vos questions. J'ose aventurer qu'il peut s'agir de mgcv::gam().
Dans ce cas,

1. Il y a beaucoup de méthodes pour faire sélection de modèles, qui ne sont pas équivalentes entre elles. L'option "select = TRUE" ajoute une pénalisation supplémentaire aux coefficients pour les pousser vers zéro (a.k.a. shrinkage), ce qui a pour effet de supprimer effectivement certains termes qui peuvent être négligés. C'est en effet une méthode de sélection de modèles.

2. Correcte, "s(., bs = 're')" est la syntaxe pour un effet aléatoire.

Cordialement,
ƒacu.-

[Margaux LEFEVRE]

Bonjour !

Oui pardon c'est bien le package mgcv :)

Merci pour ces précisions ! Je souhaite avoir la meilleure façon de travailler avec les gam ou gamm :)

Belle journée !