problème de convergence lcmm (fonction jlcmm)

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moustapha faye
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problème de convergence lcmm (fonction jlcmm)

Messagepar moustapha faye » 18 Fév 2022, 08:37

Bonjour,
J'essaie d'identifier des trajectoires d'évolution par le fonction jointlcmm. les modèles à une trajectoire tournent correctement avec une bonne convergence. Cependant, les modèles à plus d'une trajectoire ne tournent pas . voila le code (modèle à 2 trajectoires) et le message qui s'affiche après quelques minutes de calculs.

jlcmm(fixed = symp ~ ns(time, knots = 1, Boundary.knots = c(0,
1.8218)), mixture = ~ns(time, knots = 1, Boundary.knots = c(0,
1.8218)), random = ~ns(time, knots = 1, Boundary.knots = c(0,
1.8218)), subject = "id_ckdrein", ng = 2, survival = surv(Tevent,
event) ~ cause1(1) + cause2(1), hazard = c("Weibull", "Weibull"),B=mod1,
hazardtype = c("Specific", "Specific"), link = "beta", data = table_mcj,
maxiter = 200)


Statistical Model:
Dataset: table_mcj
Number of subjects: 2799
Number of observations: 9291
Number of latent classes: 2
Number of parameters: 24
Event 1:
Number of events: 1607
Class-specific hazards and
Weibull baseline risk function
Event 2:
Number of events: 702
Class-specific hazards and
Weibull baseline risk function
Link function for symp: Standardised Beta CdF

Iteration process:
The program stopped abnormally. No results can be displayed.


La fonction gridsearch aussi ne marche pas.
Dans la documentation du package, il est juste précisé que ça arrive si le paramètre conv du retournData est égale à 4 (conv==4) mais je ne vois pas la solution pour contourner ce problème. il faut préciser que ça tourne avec la fonction lcmm sans problème.
Merci pour votre aide.

Mickael Canouil
Messages : 1315
Enregistré le : 04 Avr 2011, 08:53
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Re: problème de convergence lcmm (fonction jlcmm)

Messagepar Mickael Canouil » 18 Fév 2022, 09:45

Bonjour,

Votre code n'est pas reproductible, aucune information d'où provient la fonction, de à quoi ressemble les données ou encore la sortie exacte de R.
En résumé, en l'état il est impossible de vous aider.
Mais comme, j'ai travaillé sur ces approches, je sais qu'il s'agit de {lcmm} qui a un GitHub https://github.com/CecileProust-Lima/lcmm/issues
Si vous voulez une réponse plus détaillée :

PS : en lieu et places des balises de couleur, la balise de code serait un choix plus judicieux pour afficher du code.

Cordialement,
Mickaël
mickael.canouil.fr | rlille.fr


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