Disparition d'un groupe

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Jean-Emmanuel Longueville
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Disparition d'un groupe

Messagepar Jean-Emmanuel Longueville » 31 Jan 2023, 10:43

Bonjour,
Une petite question suite à une mécompréhension des résultats du packages MASS :
Si je lance le code suivant :

Code : Tout sélectionner

nlmmass = glmmPQL(oral_genital_contact ~ time + groupe, random = ~1| individu, data = dfdata, family= "poisson"


J'obtiens le résultat suivant :

Code : Tout sélectionner

summary(nlmmass)
Linear mixed-effects model fit by maximum likelihood
  Data
: dfdata 
  AIC BIC logLik
   NA  NA     NA

Random effects
:
 Formula: ~| individu
        
(Intercept) Residual
StdDev
:   0.2635075 8.544588

Variance function
:
 Structure: fixed weights
 Formula
: ~invwt 
Fixed effects
:  oral_genital_contact ~ time + groupe 
                       Value  Std
.Error   DF   t-value p-value
(Intercept)         6.307741 0.05659602 7743 111.45202  0.0000
time                0.028386 0.00012236 7743 231.99178  0.0000
groupeSAL vers VPA 
-0.036988 0.00567758 7743  -6.51470  0.0000
groupeVPA vers SAL 
-0.079025 0.10445586   29  -0.75654  0.4554
 Correlation
: 
                   
(Intr) time   gSALvV
time               
-0.104              
groupeSAL vers VPA 
-0.033  0.000       
groupeVPA vers SAL 
-0.536  0.000  0.018

Standardized Within
-Group Residuals:
        Min          Q1         Med          Q3         Max 
-3.09327117 -0.60827939  0.09811999  0.66712749  3.22940027 

Number of Observations
: 7776
Number of Groups
: 31

Cependant mes datas contiennent 3 groupes et non deux :

Code : Tout sélectionner

unique(dfdata$groupe)
[
1] "VPA vers SAL"       "SAL vers VPA"       "SAL vers SAL mixte"

Comment puis je interpréter ces résultats par rapport au manque d'un groupe dans le summary ...
Les NA de l'AIC et autres indicateurs de qualité du modèle sont ils marqueur de soucis ?
J'ai tenté le même modèle avec le paquet LME4 dont je suis plus coutumier mais malheureusement j'ai des erreurs de singularité, ou de non convergence.
Pardon si je suis limite par rapport au règle du forum.
Jean-Emmanuel
Ingénieur d'étude LNEC

Logez Maxime
Messages : 3138
Enregistré le : 26 Sep 2006, 11:35

Re: Disparition d'un groupe

Messagepar Logez Maxime » 31 Jan 2023, 13:54

Bonjour,

Tu devrais trouver la réponse dans des posts plus anciens.
viewtopic.php?f=3&t=7813&p=36426&hilit=contraste#p36426
viewtopic.php?f=3&t=7407&hilit=contraste

(recherche contraste sur le forum)

Pour ce qui est de l'AIC and co as-tu cherché dans la littérature ? As-tu regarder ce que donnait l'exemple de la fonction ?
J'ai fait ce dernier et j'ai eu des NA, donc on peut penser que c'est normal. Mais là je suis d'accord ce n'est pas un problème en lien avec ce forum mais de statistiques, de méthodes qui permet ou non de calculer une vraisemblance.

Cordialement,
Maxime

Jean-Emmanuel Longueville
Messages : 310
Enregistré le : 23 Fév 2011, 08:03

Re: Disparition d'un groupe

Messagepar Jean-Emmanuel Longueville » 01 Fév 2023, 09:17

Merci beaucoup pour la piste de contraste je vais la creuser.
Je vais aussi creuser le Summary de mass
Jean-Emmanuel
Ingénieur d'étude LNEC


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