lire fichier excel

[Aurelie Duhec]

Bonjour,

Je debute avec le logiciel R et je rencontre bien sur quelques difficultes.

Je souhaite lire un fichier excell. Pour cela j'ai installe le package 'xlsReadWrite', en :

- selectionnant "package" dans le menu de la console
- cliquant sur "Install package com from zip file...",
- cliquant sur fichier "xlsReadWrite_1.2.3
- dans "Load package" j'ai selectionner "xls.ReadWrite"

un message m'informe que mon package a bien ete pris en compte : "package 'xlsReadWrite' successfully unpacked"

je continu alors l'etape suivante comme expliquer dans HELP :

Usage

Code : Tout sélectionner

>read.xls( file,
+colNames = TRUE,
+sheet = 1,
+type = "data.frame",
+from = 1,
+rowNames = NA, colClasses = NA, checkNames = TRUE,
+dateTimeAs = "numeric",
+stringsAsFactors = default.stringsAsFactors() )


je remplace file par le nom de mon fichier.

Mais un messge m'indique que mon fichier est non valide!

A ce stade la je ne sais pas ce que j'ai mal ou pas fais.

Je vous serais reconnaissante pour votre aide,

Merci d'avance.

[Aurélien Madouasse]

Bonjour,

Est-ce que votre fichier est dans votre répertoire de travail? Pour obtenir le répertoire courant:

Code : Tout sélectionner

getwd()

Si ça n'est pas le cas il faut soit changer le répertoire courant avec setwd, soit préciser le chemin complet dans read.xls().

Ca pourrait aussi venir du fait que vous n'avez pas mis le nom du fichier entre guillemets.

Aurélien

[Eric Pagot]

Pour cela j'utilise le package Rcmdr, c'est bien pratique car il y a un menu "importer des données". Excel en fait partie. En plus, on peut même choisir l'onglet qui nous intéresse...

[Benoît Lamy]

Pour importer des fichiers d'Excel, j'enregistre sous .csv, e.g monfichier.csv, ensuite je tape en R:
monfichier=read.table("lechemind'accès",sep=";",dec=",",header=T)
sep, c'est le séparateur. dec="," si vos chiffres décimaux en Excel sont tapées avec la virgule, et header=T pour préciser si la première ligne de votre fichier, si c'est un tableau, comporte le nom des colonnes.

Exemple:

Code : Tout sélectionner

tabledesprix=read.table(C:/lesprix.csv",sep=";",dec=",",header=T)

si le fichier correspondant est

Superficie Ville Prix
120 Paris 1350000
150 Lyon 980000
... ... ...

Bien noter le / inversé pour le chemin.

[Renaud Lancelot]

Pour cela j'utilise le package Rcmdr, c'est bien pratique car il y a un menu "importer des données". Excel en fait partie. En plus, on peut même choisir l'onglet qui nous intéresse...

Merci: cette fonctionnalité est une contribution de plusieurs des modérateurs ;-). C'est juste un carrossage des fonctions du package RODBC. Une autre présentation est disponible dans le package ttool disponible sur ce forum.

Renaud

[Dominique Soudant]

Pour un débutant, j'opterais plutôt pour un export au format texte avec tabulation comme séparateur et une lecture avec read.delim. Pour le nom du fichier, effectivement il faut bien faire attention aux "\" à remplacer par "/", sinon on peut aussi les doubler, "\\", ou utiliser la fonction file.path().

[Renaud Lancelot]

C'est pour faciliter la vie aux débutants qu'on a développé ces interfaces. Le passage par un fichier texte a pas mal d'inconvénients, notamment pour les champs facteur / caractère, les dates, etc.

Renaud

[Aurelie Duhec]

Un grand merci pour vos suggestions.

Malheureusement j'en suis toujours au meme point.

J'ai verifie si mon fichier etait bien dans le repertoire de travail.
> getwd()
[1] "C:/Documents and Settings/g2/My Documents"

Mon fichier excel est place dans My Documents...est ce que cela veut dire qu'il est bien dans le repertoire de travail?

Je tente de lire mon fichier: j'ai un message d'erreur

read.xls("AClients_Rec_20080628",
+ colNames = TRUE,
+ sheet = 1,
+ type = "data.frame",
+ from = 1,
+ rowNames = NA, colClasses = NA, checkNames = TRUE,
+ dateTimeAs = "numeric",
+ stringsAsFactors = default.stringsAsFactors() )
Error in read.xls("AClients_Rec_20080628", colNames = TRUE, sheet = 1, :
Unexpected error. Message: Can't find the file "AClients_Rec_20080628"

Je precise le chemin d'acces :
>read.xls("C:/Documents and Settings/g2/My Documents/data.xls/"AClients_Rec_20080628.xlsx")
Error: unexpected symbol in "read.xls("C:/Documents and Settings/g2/My Documents/data.xls/"AClients_Rec_20080628.xlsx"

J'ai tente plusieurs maniere d'ecrire le chemin d'acces...sans resultat!

Merci

[Dominique Soudant]

C'est pour faciliter la vie aux débutants qu'on a développé ces interfaces

C'est pour ça que j'importe mes données avec l'argument colClasses = "character". Mais bon, peut être qu'à l'instar d'un Linux vs. Windows on a là un sujet de flamewar, alors, interface ou pas, l'essentiel est d'arriver à faire ce que l'on veut :) .
Rcmdr ne marche plus en R 2.4.1.

AClients_Rec_20080628.xlsx

C'est vraiment le nom de ton fichier excel ? Dans le premier code tu ne spécifie pas l'extension ... y faut ou pas ?

[Benoît Lamy]

Ma remarque est peut-être idiote, mais ce ne serait pas la deuxième paire de guillemets qui fait planter?

read.xls("C:/Documents and Settings/g2/My Documents/data.xls/"AClients_Rec_20080628.xlsx")

En fait, je me demande même si tu ne devrais pas bazarder /data.xls" et garder:
read.xls("C:/Documents and Settings/g2/My Documents/AClients_Rec_20080628.xlsx")

A moins que read.xls soit incompatible avec des fichiers en .xlsx?

Ou sinon, essaye par le .csv comme je t'ai conseillé.

[Aurelie Duhec]

BENOIT,

Precedement je ne me suis pas trompee sur la console pour ecrire le chemin d'acces...vous avez raison c'est certeinement la version 2007 qui ne lui plait pas.

Je suis passee en .csv :

TRL=read.table("C:/Documents and Settings/g2/My Documents",sep=",",header=T)
Error in file(file, "r") : cannot open the connection
In addition: Warning message:
In file(file, "r") :
cannot open file 'C:/Documents and Settings/g2/My Documents': Permission denied

TRL.csv=read.table("C:/Documents and Settings/g2/My Documents",sep=",",header=T)
Error in file(file, "r") : cannot open the connection
In addition: Warning message:
In file(file, "r") :
cannot open file 'C:/Documents and Settings/g2/My Documents': Permission denied


je vais convertir mon fichier xlsx en xls ! Je vais voir ce que ca va donner

Merci Beaucoup pour votre aide!

[Aurelie Duhec]

Desole Benoit je viens de me rendre compte que j'ai ecris n'importe quoi! c'est la fatigue qui arrive!

En reprenant votre exemple voila ce que j'ecris:

TRL=read.table("C:/TRL.csv",sep=";",dec",",header=T)

Error: unexpected string constant in "TRL=read.table("C:/TRL.csv",sep=";",dec",""

Je suis en train de faire avec Rcmdr, mais cela m'ennuie de ne pas comprendre pourquoi ca ne fonctionne pas!

Merci beaucoup pour tout.

[Renaud Lancelot]

1. Evitez d'utiliser le symbole "=" comme opérateur d'affectation. Préférer "<-" à la place. Cela peut expliquer certaines erreurs.

2. Utiliser TRUE (ou FALSE) au lieu de T (ou F).

D'autre part, aérer le code avec des espaces: cela facilite la lecture et permet de repérer des erreurs triviales. Votre commande devient alors:

Code : Tout sélectionner

TRL <- read.table("C:/TRL.csv", sep = ";", dec",", header = TRUE)


et on s'aperçoit immédiatement qu'il manque un "=" entre dec et ",".

CQFD...


Donc:

Code : Tout sélectionner

TRL <- read.table("C:/TRL.csv", sep = ";", dec = ",", header = TRUE)

et ça devrait aller mieux.

Renaud

[Aurelie Duhec]

Voila voila c bon !! Enfin !

Bon c'etait une chose toute bete ...

- premierement il falait bien convertir le fichier xlsx en version 2003.
- ensuite il fallait suprimer les formules, voila ce qui me bloquait !

Merci pour tout

[Benoît Lamy]

1. Evitez d'utiliser le symbole "=" comme opérateur d'affectation. Préférer "<-" à la place. Cela peut expliquer certaines erreurs.

Ah?? J'utilise systématiquement le "=". Il ne faut pas?