A l'aide du package ade4, j'airéalisée une AFC sur mes données regroupées en classes. J'en maintenant à l'interprétation des différents plans. Pour faire cette interprétation, je m'aide entre autres des contributiosn des variables aux axes. Donc jusqu'ici tout va bien sauf que je me suis aperçu que sur les 10 premiers axes de mon AFC, les axes 1 et 10, et les axes 2 et 9 ont respectivement les mêmes variables contributives, avec exactement les mêmes valeurs. Je ne comprend pas vraiment comment c'est possible, mais en plus de ça, quand je regarde les coordonnées de mes individus, ils ne sont pas identiques du tout sur ces axes...
Voici mon script et ce que me renvoie R pour les contributions des variables :
Code : Tout sélectionner
> z2<-dudi.coa(va2,scannf=F,nf=12)
> ctrv_abs<-inertia.dudi(z2,col.inertia=T)$col.abs
> ctrv_abs
Comp1 Comp2 Comp3 Comp4 Comp5 Comp6 Comp7 Comp8 Comp9 Comp10
TeR.A 208 75 0 0 0 0 5340 2217 75 208
TeR.B 1622 1244 83 648 24 5 1025 713 1244 1622
TeR.C 177 617 11 4602 1039 526 160 320 617 177
TeR.D 12 1111 1427 2439 8 74 1230 1211 1111 12
TeR.E 304 26 25 264 7492 77 9 458 26 304
TeR.F 466 0 4900 63 16 1431 830 1014 0 466
TeR.G 127 514 244 1352 488 732 1363 4006 514 127
TeR.H 1650 869 2 128 725 3531 0 54 869 1650
TeR.I 434 545 3308 503 207 3624 43 8 545 434
NivR.1 1340 2179 0 0 0 0 0 0 2179 1340
NivR.2 124 2441 0 0 0 0 0 0 2441 124
NivR.3 3536 380 0 0 0 0 0 0 380 3536
Quelqu'un aurait-il une explication à me proposer? D'avance merci.
Christel