Questions sur Wilcox.test

[Thierry Gautrot]

Bonjour,

J'ai un jeu de données sous la forme suivante :
Volume d'un arbre - Nb d'espèces saprolignicoles - Nb d'espèces non saprolignicoles.
Je souhaite tester l'hypothèse ": la diversité spécifique (non sapro-lignicoles et sapro) est indépendante du volume de l'arbre".
Je teste avec Wilcox.test deux à deux (volume/sapro. ; volume/nonsapro) mais mon JDD est très faible pour les sapro. et j'obtiens le résultat suivant :
> vns2
VolFut Sapro
1 2.16 0
2 2.16 1
3 1.92 0
4 4.89 0
5 0.57 0
6 0.35 0
7 0.33 0
8 0.58 0
9 0.93 0
10 0.32 0
11 0.24 0
12 0.95 0
13 0.91 0
14 0.17 2
15 0.38 0
16 0.51 0
17 1.06 0
18 0.33 0
19 0.49 2
20 0.92 0
21 0.94 0
22 0.12 0
23 1.56 0
24 0.21 0
> wilcox.test(VolFut,Sapro)

Wilcoxon rank sum test with continuity correction

data: VolFut and Sapro
W = 516, p-value = 9.55e-07
alternative hypothesis: true location shift is not equal to 0

Warning message:
In wilcox.test.default(VolFut, Sapro) :
impossible de calculer la p-value exacte avec des ex-aequos

i) le test peut-il être considéré comme significatif ?(0.00000095 chances de se tromper si je rejette mon hypothèse ?)
ii) quel est la signification de W =516 ?
iii)faut-il utiliser un autre test pour ce type de JDD ?

Merci !!
Thierry
[/i]

[Vincent Boulanger]

Bonjour,

je crains que le jeu de données ne soit effectivement très et trop faible dans le cas des sapro-lignicoles.

Il pose le problème d'un fort déséquilibre:
21 arbres avec 0 espèce sapro --> modalité 1
1 arbre avec 1 espèce sapro --> modalité 2
2 arbres avec 2 espèces non sapro --> modalité 3


Là, je pense que le test de wilcoxon, même s'il tourne, est utilisé abusivement étant donné la structure du jeu de données.

Un bon graphique illustrera fort bien et ne risque pas d'attirer les foudres de statisticiens ;-)

Bon courage

VB

[Thierry Gautrot]

Merci !