package BRugs pour Linux

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Stéphane Laurent
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package BRugs pour Linux

Messagepar Stéphane Laurent » 24 Nov 2009, 16:18

Bonjour,

Pas moyen d'installer le package BRugs avec Linux, ni avec le menu "Packages" quand on utilise R en mode graphique, ni avec la fonction install.packages().

Comment faire ?..

Matthieu Stigler
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Messagepar Matthieu Stigler » 25 Nov 2009, 09:00

Quelle distribution utilises-tu?

Si sur Debian-Ubuntu, as-tu utilisé

Code : Tout sélectionner

sudo apt-get install r-cran-RBugs


ou qqch du genre? Peux essayer ce soir à la maison si tu veux...

Stéphane Laurent
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Messagepar Stéphane Laurent » 25 Nov 2009, 11:40

Hello,

Je crois que c'est Debian-Ubuntu (pas sûr... en fait je donne des TP à des étudiants mais moi j'utilse Windows).

Non je n'ai pas essayé la commande que tu donnes. Mais je croyais comprendre que le message d'erreur disait que BRugs n'était pas disponible.. alors que pas de problème avec Windows.

Linux c'est bien, quand on sait s'en servir...

Aurélien Madouasse
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Messagepar Aurélien Madouasse » 25 Nov 2009, 12:10

Le package n'est plus disponible sur le CRAN:http://cran.r-project.org/web/packages/BRugs/
Voir peut-être d'anciennes versions ou JAGS.
Aurélien

Stéphane Laurent
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Messagepar Stéphane Laurent » 25 Nov 2009, 12:40

Ben pourquoi il n'est plus disponible ?..

Est-ce que JAGS ressemble à OpenBUGS ?

Aurélien Madouasse
Messages : 352
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Messagepar Aurélien Madouasse » 25 Nov 2009, 13:22

Je n'ai jamais utilisé JAGS (Just Another Gibbs Sampler), mais de ce que j'en ai lu, c'est assez similaire à Bugs. Voir par exemple:
http://w3.jouy.inra.fr/unites/miaj/public/matrisq/Contacts/applibugs.07_11_08.plummer.pdf
Sinon, il est possible d'utiliser WinBUGS sous Linux avec Wine. Ca marche, de même que R2WinBUGS. Je l'ai fait il y a longtemps, je ne me rapelle plus des détails, mais ça n'est pas extrêment compliqué, même pour un non-expert.
Aurélien

Matthieu Stigler
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Messagepar Matthieu Stigler » 25 Nov 2009, 15:13

Sinon essayer:
The packages
BRugs, ncdf, RCurl, RNetCDF, udunits, and XML
do not build out of the box or other special in other circumstances.
Nevertheless these are available at
http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin/bin/ ... trib/2.10/
kindly provided by Professor Brian D. Ripley.

Stéphane Laurent
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Messagepar Stéphane Laurent » 26 Nov 2009, 13:09

Merci Aurélien. Mais JAGS ne me convient pas, je suis focalisé sur le langage BUGS.

Matthieu, ce n'est pas spécifique à Windows le lien que tu donnes ?


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