R et systat

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Eric Pagot
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R et systat

Messagepar Eric Pagot » 16 Fév 2007, 15:21

Bonjour,

Je travaille pour des labos en recherche clinique (animale, phase terrain). Nous sommes amenés à utiliser des stats et dans notre structure (petite) et c'est plutôt moi qui me suis spécialisé dans ce domaine.
Nous utilisons systat comme logiciel de statistique (assez convivial comme présentation), mais je me suis aperçu qu'il manquait quelques tests (pourtant, nous en utilisons très peu).
Dans un premier temps, j'ai essayé de me familiariser avec le logiciel R. Les lignes de commandes sont assez rébarbatives pour qui n'est pas familiarisé avec ce système.
Dansun deuxième temps, j'ai constaté qu'il existe une interface graphique, qui me paraît d'une utilisation plus simple pour mes collègues.
J'essaye de reproduire les avantages de systat dans l'interface, mais ce n'est pas très évident de dépouiller toutes les lignes de code que j'ai retrouvé (répertoire R).
Quelques questions :
- d'un point de vue programmation :
Comment fait-on pour rajouter (ou enlever) des menus dans l'interface ?
Est-il possible de rajouter des icônes ?
Est-il possible de mettre des dessin dans la fenêtre de sortie ?
- d'un point de vue statistique :
J'ai refait une anova simple sur des données que j'avais, les valeurs ne sont pas tout à fait les mêmes. Est-ce R ou systat le plus juste ?
Je ne retrouve pas du tout les mêmes valeurs quand j'utilise une variable d'ajustement (poids initiale pour une croissance).
le modèle que j'ai utilisé est GMQ=groupe*sexe*ferme+Poids1
Peut-être que ce n'est pas correct...
En tous cas, la sortie est la même que sous systat. Les valeurs qui s'en rapprochent le plus sont une sortie avec anova (a en majuscule).

Merci, si quelqu'un s'intéresse à mon cas.

Logez Maxime
Messages : 3138
Enregistré le : 26 Sep 2006, 11:35

Messagepar Logez Maxime » 16 Fév 2007, 16:10

Bonjour,


Je ne peux pas répondre à toutes tes questions puisque je ne connais pas systat, mais déjà il est psa très "normal" de trouver des résusltats différents sur une anova, si la différence se fair à le je ne sais combien-t-ième virgule c pas trop génant mais si c'est dans les premières décimales ce n'est pas très logique. Une seule façon de savoir la faire à la main et comparer les résultats (un peu long mais bon ...). L'interface graphique est en tcl/tk donc du moment que tu maitrises ce language tu devrais pouvoir faire tout ce que tu souhaites. Quand a ton modèle fait très attention quand à l'emploi des * dans la formule, en effet un modèle de type lm(y~x*z) veut dire que tu vas prendre en compte à la fois les paramètres x et z pour expliquer y mais aussi l'interaction de x et z alors que si tu tapes lm(y~I(x*z)) la tu expliques y avec une variable qui est le produit de x et z. Il existe de nombreux pdf en ligne qui explique comment rédiger la formule d'un modèle sous R.
Après a toi de voir si l'investissement en temps afin de maitriser suffisement R pour ton usgae sera rentable.

Maxime


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