Exécution très lente des commandes

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Bienvenue KOUWAYE
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Exécution très lente des commandes

Messagepar Bienvenue KOUWAYE » 28 Nov 2012, 12:14

Bonjour Cher tous,
Quand je lance une commande sous R, comme un modèle
mod<- lm(Y~X, data = data)
par exemple l'exécution est très lente ça prend énormément de temps.
Je ne sais pas ce qu'il faut pour accélérer R
Je voudrais savoir comment faire
merci bien
KOUWAYE BIENVENUE
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STATISTIQUE APPLIQUEE
Université Paris 1 Panthéon Sorbonne (France)
Laboratoire SAMM
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matthieu faron
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Messagepar matthieu faron » 28 Nov 2012, 18:51

Bonjour,

Le plus souvent l’exécution est plutôt rapide je trouve ! Qu'est ce que vous appelez lent ? Plusieurs secondes ? Quel est la taille de votre jeux de données ?

Même pour une régressions simple avec 10.000 données :

Code : Tout sélectionner

> y <- rnorm(10000)
> x <- y * 0.8 + 5 + rnorm(10000) / 10
> system.time(
+ lm(y ~ x)
+ )
utilisateur     système      écoulé
       0.02        0.00        0.01
>
Matthieu FARON

Bienvenue KOUWAYE
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Messagepar Bienvenue KOUWAYE » 29 Nov 2012, 08:16

matthieu faron a écrit :Bonjour,


Le plus souvent l’exécution est plutôt rapide je trouve ! Qu'est ce que vous appelez lent ? Plusieurs secondes ? Quel est la taille de votre jeux de données ?

Même pour une régressions simple avec 10.000 données :

Code : Tout sélectionner

> y <- rnorm(10000)
> x <- y * 0.8 + 5 + rnorm(10000) / 10
> system.time(
+ lm(y ~ x)
+ )
utilisateur     système      écoulé
       0.02        0.00        0.01
>


Quand je dis lent j'ai constaté que une commande qui me prenait à peine 4 seconde de compilation me prend maintenant 9minutes. J'ai une petite base de données. 20 variables avec 600 observations et je fais du glmmLasso() avec R.2.13 ça va mais avec R.2.15 c'est très lent.
Merci
KOUWAYE BIENVENUE

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