Bonjour,
Je dispose de plusieurs objet de classe "phylo" et je veut les mettre en graph . Je souhaite colorer les branches et nœuds interne quand/si tout ce qui e trouve au delà du nœud appartient au même groupe de coloration, et tout ce qui coresponds à des clades mélangés soit par exemple en gris.
Exemple trivial: J'étudie la phylogénie des variété de petits pois qui peuvent être:
-Vert
-Jaune
-Rouge (parce que les petits pois sont rouges)
J'ai donc un objet "Color_of_tips" qui permet d'afficher les labels de la bone couleurs…
Les petits pois verts et jaunes sont mélangé donc au mieux j'ai 2/3 branche enssemble d'une même couleur… les rouge sont dans un clade exclusif (donc un tièr des échantillons depuis la racine, tout en rouge…
Comment généré un telle objet de façon intéligente ?