Test post-hoc après GLMM

[Mathilde Lalot]

Bonjour,

Mes données comportent une variable dépendante qui suit une loi binomiale (1,0) et trois variables indépendantes (période, testé, receveur). Mes données sont non-paramétriques, appariées et répétées. Mes échantillons ne sont pas de même taille. J'ai réalisé un GLMM mais je bloque pour le choix du test post-hoc. Je n'ai pas le droit d'utiliser le Tukey dans ces conditions, quel tests puis-je utiliser ?
Après recherches, il me semble que le "Unequal N HSD" serait idéal, non ? Comment le fait-on avec R ?

Merci d'avance !

[Maxime Hervé]

Bonjour,

package 'lsmeans', fonction lsmeans(), méthode des... LSMeans.

Maxime

[Mathilde Lalot]

Merci beaucoup !

Pourriez-vous me préciser dans quel cas utiliser glht() et dans quel cas utiliser lsmeans() ? Y en a-t-il un qui fournit les interactions mieux que l'autre ?

[Maxime Hervé]

lsmeans() s'appuie en fait sur glht(). Personnellement je préfère lsmeans() que je trouve plus souple et plus riche (pour ce que je fais en tout cas).

Maxime

[Mathilde Lalot]

Merci beaucoup !

[Delphine Meziere]

Bonjour,

J'ai fait un GLMM Poisson et je voudrais faire des comparaisons de modalités 2 à 2 pour les facteurs qui ont un effet significatif (l'équivalent du test de Tuckey ou du test LSD pour les modèles linéaires "normaux").
Avec la fonction lsmeans, on obtient les moyennes par modalités avec les intervalles de confiance mais comment (est-ce possible déjà ?) obtenir la significativité des différences entre chaque modalité ?

merci !