les dendogrammes

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Armelle PAULE
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les dendogrammes

Messagepar Armelle PAULE » 23 Oct 2007, 15:58

bjr, comme je débute dans R, j'ai quelques petites questions

1) j'ai réalisé un dendogramme (avec la fonction hclut) à partir d'une matrice initiale presence absence que j'ai transformé en matrice de distance. léchelle de mon dendro est exprimée en "height", est il possible de la transformer en % de similarité.

2) toujours à partir de cette même matrice j'ai réalisé un test nmds par (nmds(dist,k=2)) tt d'abord est ce correct? et j'obtient une valeur de "stress" de l'ordre de 14 (unité en % je pense) , quelle doit être sa valeur limite?
armelle

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