[ Résolu ] Utiliser metaMDS (package vegan)

[Marine Duperat]

Bonjour à tous,

je souhaiterais utiliser la fonction metaMDS() du package "vegan" mais impossible de le faire tourner sur mes données.
Je ne comprends vraiment pas pourquoi...

En données j'ai un tableau (sh1) avec en ligne des dates de relevés (caractères), en colonne des noms d'espèces (caractères) et en valeurs des abondances (numériques).

Code : Tout sélectionner

> head(sh1)
        Agrostis capillaris Agrostis sp Agrostis stolonifera Betula pendula
2011_1                    0           0                    1              0
2011_10                   0           0                    0              3
2011_11                   0           0                    0              5
2011_12                   0           0                    0              2
2011_13                   0           0                    0              0
2011_14                   0           0                    0              2
     

La formule que je veux utiliser est celle-là :

Code : Tout sélectionner

metaMDS<-(sh1, distance="horn")

Et voila ce que R me répond :

Code : Tout sélectionner

r : ',' inattendu(e) in "metaMDS<-(sh1,"

Si quelqu'un a une solution pour aider une novice, je suis preneuse,
merci d'avance

[Gabriel Terraz]

Salut,
Je pense que tu confonds la fonction que tu veux utiliser avec le nom que tu veux donner à ton objet, résultant de cette fonction. essaie :

Code : Tout sélectionner

tonobjet <- metaMDS(sh1, distance="horn")

[Marine Duperat]

Bon. Je devais vraiment être fatiguée hier pour pas voir mon erreur....
Je me sens un peu bête du coup.

Merci de ta réponse en tout cas ! Forcement, ça marche beaucoup mieux.

Marine.