Le package gene : géostatistiques & microsatellites

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Jean-Pierre Rossi
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Le package gene : géostatistiques & microsatellites

Messagepar Jean-Pierre Rossi » 27 Juin 2016, 15:30

Bonjour,
Ce message pour vous informer de la diffusion sur R-Forge d’un nouveau package nommé « ggene ». Il s’agit d’un ensemble d’outils permettant le traitement géostatistiques de données microsatellites. L’article de Wagner et al (2005) expose le lien entre géostats et génétique et le package a été construit pour fournir un outil permettant de mettre en œuvre cet outil.
Vous trouverez tous les détails sur le site http://www1.montpellier.inra.fr/CBGP/so ... index.html
Le package comporte deux vignettes présentant l’ensemble des fonctions disponibles illustrées par des exemples détaillés.

Je serais très intéressé par vos remarques, suggestions, commentaires et questions qui devraient me permettre d’améliorer ggene.
Merci !

Référence
Wagner, H.H., Holderegger, R., Werth, S., Gugerli, F., Hoebee, S.E., Scheidegger, C., 2005. Variogram analysis of the spatial genetic structure of continuous populations using multilocus microsatellite data. Genetics 169, 1739-1752.
Jean-Pierre Rossi
INRA, UMR CBGP (INRA / IRD / Cirad / Montpellier SupAgro)
Campus international de Baillarguet, France

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