MCMCglmm et crash de R

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Anais Edme
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MCMCglmm et crash de R

Messagepar Anais Edme » 13 Oct 2016, 14:25

Bonjour

J'utilise le package MCMCglmm pour calculer l'heritabilite d'un trait. J'ai suivi les instruction du WAMWiki qui marche impec pour me former.
Mais des que j'utilise mes donnes ca coince, en effet, R crash des que j'ajoute le pedigree dans mon MCMCglmm. mon ficher data comporte 12000 lignes et mon pedigree un peu plus de 8000.
Ce model marche : model1<-MCMCglmm(A~B+C+D,random=~E+F,data=data,prior = prior1, verbose=TRUE)
mais celui la fait tout plante: model2<-MCMCglmm(A~B+C+D, random=~E+F,data=dataexp,pedigree=pedexp,prior = prior1,verbose=TRUE). La chaine ne se declanche pas et au bout de 2 minutes R plante et redemarre. Est ce du a la taille de mes fichiers ?
Des idees ?

Merci
Enfe-R

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