heritability avec R

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latyr diouf
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heritability avec R

Messagepar latyr diouf » 06 Mar 2017, 04:30

je veux faire heritability avec R mais je ne comprends pas ecactement comment ca fonctionne.
J'ai suivi des videos sur internet mais ils ne resolvent pas mon probleme.
J'ai 10 traits avec une population de 277 individus.
Ensuite quand je compute pour ANOVA, je peux avoir le resultat d'un seul trait alors que j'ai besoin le resultat de l'anova pour les 10 traits et ensuite utilise les resultats de l'anova pour faire (broad sens heritability).Quand je fais entrer plusieurs traits au meme moment a la place de "MDA", j'ai automatiquement une erreur. Si quelqu'un peut aider???.
J'utilise R version 3.3.2
data= X_Parent_F2_150mMCSV
aov1<-aov(MDA~TRT+ACC+TRT:ACC,data = X_Parent_F2_150mMCSV)
> aov1
Call:
aov(formula = MDA ~ TRT + ACC + TRT:ACC, data = X_Parent_F2_150mMCSV)

Terms:
ACC Residuals
Sum of Squares 0.170213 0.038961
Deg. of Freedom 274 542

Residual standard error: 0.008478429
275 out of 550 effects not estimable
Estimated effects may be unbalanced
23 observations deleted due to missingness
> summary(aov1)
Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
ACC 274 0.17021 0.0006212 8.642 <2e-16 ***
Residuals 542 0.03896 0.0000719
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
23 observations deleted due to missingness

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