Bonjour à tous,
Je rencontre un problème avec la fonction CA du package FactoMineR. J'ai fait une AFC sur un tableau de contingence qui résume le nombre de captures par espèce à deux sites au cours de sessions de capture réalisées en parallèle. J'ai donc fait un tableau avec en ligne mes sessions par site (session 1 site 1, session 2 site A, ... Session 1 site B session 2 site B, ... etc), et en colonne les espèces. Mon but est de voir si les sessions par site se regroupent plutôt selon le site (plus grande importance de l'hétérogénéité spatiale sur la composition de la communauté) ou selon la date (plus grande importance de la période de l'année sur la composition de la communauté).
J'observe sur le graphique d'AFP un regroupement des sessions-site principalement selon le site (sessions au site A regroupées d'un côté et sessions au site B de l'autre). J'aimerai mieux illustrer cela en ajoutant une variable supplémentaire qualitative via l'argument quali.sup, afin de pouvoir faire figurer "Site A" au barycentre des sessions-site réalisées au site A, et "Site B" au barycentre des sessions réalisées au site B. Pour cela j'ai ajouté une colonne "Site" à mon tableau de départ avec les valeurs "Site A" ou "Site B" pour chaque ligne. Cependant cet ajout a fait passer toutes mes colonnes en type "character", et je n'arrive pas à refaire passer les autres colonnes au format de départ (integer), et je ne peux plus faire d'AFC sur le tableau car il ne reconnais pas les variables de type character... Quelqu'un saurait-il comment faire passer les autres colonnes en integer? Ou une autre manière d'ajouter une variable illustrative qualitative pour rendre plus visible le regroupement de selon le site?
Merci d'avance,
Jan