Appliquer une AFC avec des points échantillonnés plusieurs années de suite

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Manon Jean
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Appliquer une AFC avec des points échantillonnés plusieurs années de suite

Messagepar Manon Jean » 24 Mai 2017, 14:09

Bonjour,

Je voudrais savoir si c'est possible de réaliser une AFC avec un tableau de relevés faits sur plusieurs années. Voici un exemple de tableau :

Code : Tout sélectionner

   num annee Accenteur_mouchet Aigrette_garzette Alouette_des_champs
  D45  2003                 0                 0                   0
  D48  2003                 0                 0                   0
  D49  2003                 0                 0                   0
  E44  2003                 1                 0                   1
  E45  2003                 1                 0                   2
  D45  2004                 1                 0                   0
  D48  2004                 0                 0                   0
  D49  2004                 0                 0                   0
  E44  2004                 1                 0                   0
 E45  2004                 1                 0                   0
 D45  2005                 0                 0                   0
 D48  2005                 1                 0                   0
 D49  2005                 0                 0                   0
 E44  2005                 0                 0                   1
 E45  2005                 0                 0                   1


avec num les points de relevés et annee les années.
Là j'ai trois espèces mais il y en a beaucoup plus en réalité.
J'ai été habituée à rentrer des tableaux pour AFC de cette forme plutôt, car on ne peut pas avoir des tableaux avec des lignes dupliquées :

Code : Tout sélectionner

 Accenteur_mouchet Aigrette_garzette Alouette_des_champs
1                  0                 0                   0
2                 0                 0                   0
3                 0                 0                   0
4                 1                 0                   1
5                 1                 0                   2
6                 1                 0                   0
7                 0                 0                   0
8                 0                 0                   0
9                 1                 0                   0
10                 1                 0                   0
11                 0                 0                   0
12                 1                 0                   0
13                 0                 0                   0
14                 0                 0                   1
15                 0                 0                   1


Savez-vous si c'est possible de faire une AFC en prenant en compte l'année (et donc les relevés dupliqués) ?

Dominique Soudant
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Enregistré le : 23 Avr 2008, 11:12
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Re: Appliquer une AFC avec des points échantillonnés plusieurs années de suite

Messagepar Dominique Soudant » 24 Mai 2017, 16:36

Question stat pas R.
Tu as une structure Lieux*Années*(occurences d'espèces) ?
=> Analyse Tiradique Partielle ?
cf http://archimer.ifremer.fr/doc/00315/42648/ p76 et suivantes

Bon courage
@+

EDIT 00 une recherche google avec "Analyse triadique partielle" peut aussi être de bon goût, des résultats pointent ici même ...

Manon Jean
Messages : 14
Enregistré le : 04 Mai 2017, 15:08

Re: Appliquer une AFC avec des points échantillonnés plusieurs années de suite

Messagepar Manon Jean » 24 Mai 2017, 18:03

d'accord merci beaucoup ! Je pensais que c'était du R comme c'était un souci de mise en forme de tableau mais si il y a plus simple tant mieux !
merci encore !


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