comparaison post hoc après modèle linéaire mixte

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Rachid Khelifi
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comparaison post hoc après modèle linéaire mixte

Messagepar Rachid Khelifi » 05 Aoû 2017, 22:19

Bonjour, je démarre les analyses linéaires mixtes.
J'ai des données qui proviennent d'une expérience où je m'intéresse aux durées de fixation (entre autres...) sur des mots au cours de la lecture d'un texte.
J'ai un facteur groupe (fixed factor) avec trois niveaux: adultes, lecteurs CE2 et lecteur CM2) et deux facteur aléatoires (sujets et mots). mon modèle est le suivant :
> m0<-lmer(dureefixation~(1|nsujet)+(1|items),data=dongenMO)
> m1<-lmer(dureefixation~Groupe+(1|nsujet)+(1|items),data=dongenMO)

j'ai un effet groupe significatif (p<.001). Je voudrai effectuer des comparaisons multiples, c'est-à-dire comparer les CE2 aux CM2, les CE2 aux Adults et les CM2 au adultes pour montrer s'il existe des différences entre les 3 groupes.
J'ai utilisé la fonction lsmean "> lsmeans(dongenMO,pairwise~Groupe) mais j'ai un message d'erreur suivant:

« Error in ref.grid(object = list(items = c(21L, 22L, 11L, 23L, 24L, 25L,  :

 Can't handle an object of class  “data.frame”

 Use help("models", package = "lsmeans") for information on supported models. ».

Multiple comparisons in linear mixed analysis. Available from: https://www.researchgate.net/post/Multi ... d_analysis [accessed Aug 6, 2017].

Où se trouve l'erreur?
Merci d'avance pour une aide ou un conseil
Rachid

Maxime Hervé
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Re: comparaison post hoc après modèle linéaire mixte

Messagepar Maxime Hervé » 06 Aoû 2017, 06:31

Bonjour,
l'erreur est que vous avez donné votre tableau de données en argument à lsmeans(), alors que la fonction attend un modèle. C'est donc plutôt :

Code : Tout sélectionner

lsmeans(m1,pairwise~Groupe)

Maxime

Rachid Khelifi
Messages : 4
Enregistré le : 19 Juil 2017, 21:52

Re: comparaison post hoc après modèle linéaire mixte

Messagepar Rachid Khelifi » 06 Aoû 2017, 09:44

Un grand merci pour votre aide Maxime, ça marche très bien comme ça!
Rachid


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