package cosinor : interprétation résultats

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sebastien baek
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Enregistré le : 09 Nov 2017, 10:41

package cosinor : interprétation résultats

Messagepar sebastien baek » 09 Nov 2017, 10:48

Bonjour à tous,

Je fais des analyses de rythmicité avec la fonction Cosinor (package cosinor). Les lignes de codes entrées fonctionnent parfaitement mais je n’ai trouvé aucun document me permettant d’interpréter les résultats ci-dessous. J’obtiens plusieurs p-valeurs significatives mais je n’ai aucune idée des hypothèses testées sur, notamment, l’acrophase et l’amplitude. Et j’en sais encore moins sur les ‘rrr’, ‘sss’,… Quelqu’un aurait-il des informations sur l’interprétation des résultats de l’analyse cosinor issus du package cosinor ?

Un grand merci pour l’aide que vous pourrez m’apporter !!



> fit <- cosinor.lm(Value ~ time(Time) + X + amp.acro(X), data = data, period = 24)
> summary(fit)

Raw model coefficients:
estimate standard.error lower.CI upper.CI p.value
(Intercept) 45.9112 5.4567 35.2162 56.6062 0.0000
X -7.9193 7.7170 -23.0443 7.2058 0.3048
rrr 16.9139 7.7170 1.7888 32.0389 0.0284
sss 25.1120 7.7170 9.9870 40.2370 0.0011
X:rrr 10.2701 10.9135 -11.1199 31.6601 0.3467
X:sss -21.9507 10.9135 -43.3406 -0.5607 0.0443

***********************

Transformed coefficients:
estimate standard.error lower.CI upper.CI p.value
(Intercept) 45.9112 5.4567 35.2162 56.6062 0.0000
[X = 1] -7.9193 7.7170 -23.0443 7.2058 0.3048
amp 30.2769 7.7170 15.1519 45.4019 0.0001
[X = 1]:amp 27.3672 7.7170 12.2422 42.4922 0.0004
acr 0.9781 0.2549 0.4785 1.4776 0.0001
[X = 1]:acr 0.1158 0.2820 -0.4369 0.6684 0.6814

sebastien baek
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Enregistré le : 09 Nov 2017, 10:41

Re: package cosinor : interprétation résultats

Messagepar sebastien baek » 14 Nov 2017, 16:49

Pour exemple sur cette même fonction (ce sera peut-être plus clair) :

https://rdrr.io/cran/cosinor/man/summar ... or.lm.html

Je ne comprends toujours pas l'interprétation de ces résultats... Quelles sont les hypothèses testées derrières ces P values? Et les infos données me permettent-elles de définir si j'ai en effet une rythmicité?

Merci pour votre aide ;)


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