Néanmoins, j'ai un message d'erreur,
Voici mon script:
Code : Tout sélectionner
m6=aov(sqrt(Nb_cellules)~(Algicide+Nitrate+HCl)^2,data=groupe)
shapiro.test(m6$residuals)
x11()
qqnorm(m6$residuals)
qqline(m6$residuals)
#La normalité n'est pas totalement suivie néanmoins ce sont les donnnées
#transformées avec la racine carrées qui ont les résidus les plus normaux.
#Le plus important pour une anova c'est surtout l'homogénéité des résidus
x11()
plot(m6$residuals~m6$fitted)
#Les résidus sont homogènes et indépendants.
Anova(m4,type="III")
Du coup, suite à cela voici le message d'erreur:
Error in Anova.III.lm(mod, error, singular.ok = singular.ok, ...) :
there are aliased coefficients in the model
Et voici le summary du tableau que j'utilise:
Code : Tout sélectionner
summary(groupe)
Groupe Plaque Puits Nitrate HCl Algicide
GA:380 MLGLQ : 60 B6 : 19 N-:190 H-:310 A-:262
GB: 0 AMMM : 40 C6 : 19 N+:190 H+: 70 A+:118
GC: 0 CDPCHF : 40 A2 : 18
GD: 0 FBNG : 40 D1 : 18
GE: 0 MMSDALT: 40 D5 : 18
CRMN : 20 A4 : 17
(Other):140 (Other):271
DObrute valeurblanc DOcor Nb_cellules
Min. :0.0310 Min. :0.02500 Min. :0.0000 Min. : 41429
1st Qu.:0.2188 1st Qu.:0.02600 1st Qu.:0.1643 1st Qu.: 3793402
Median :0.3310 Median :0.02900 Median :0.2920 Median : 6711603
Mean :0.6996 Mean :0.03657 Mean :0.6632 Mean :15190466
3rd Qu.:0.8500 3rd Qu.:0.05000 3rd Qu.:0.8197 3rd Qu.:18767028
Max. :3.0000 Max. :0.06300 Max. :2.9750 Max. :67999535
J'espère ne pas trop m'être embrouillée et que ce soit compréhensible :)
Merci d'avance pour m'aider à débloquer ce message d'erreur ;)