Voulant tester la proportion d'individus présents dans 2 catégories (stoc 649 et stoc 650) pour séries appariées, j'aimerai réaliser un test binomial exact avec la fonction binom.test. Voici un extrait de mon jeu de données :
Code : Tout sélectionner
>data
espece annee stoc_649 stoc_650
9 ANTTRI 2017 2 2
13 DENMAJ 2013 1 1
15 DENMAJ 2017 1 1
20 EMBCIT 2017 1 2
21 ERIRUB 2013 9 8
22 ERIRUB 2014 4 15
23 ERIRUB 2015 3 11
> str(data)
'data.frame': 29 obs. of 4 variables:
$ espece : Factor w/ 25 levels "AEGCAU","ANTTRI",..: 2 5 5 6 7 7 7 7 9 11 ...
$ annee : Factor w/ 5 levels "2013","2014",..: 5 1 5 5 1 2 3 4 1 1 ...
$ stoc_649: int 2 1 1 1 9 4 3 6 3 4 ...
$ stoc_650: int 2 1 1 2 8 15 11 8 1 1 ...
EN suivant l'"Aide mémoire" de Maxime Hervé, le premier argument de binom.test (x) doit être "les paires dont le premier individu est de catégorie 1 (stoc 649) et le second de catégorie 2 (stoc 650)" et le second argument de la fonction (n) doit être "le nombre de paires d'individus dont les valeurs diffèrent". C'est là que je sèche...je n'arrive à formaliser concrètement la signification de ces deux phrases.
Merci d'avance de votre précieuse aide.
Cordialement,
Jonathan