Installation d'udsAnova sous R

Postez ici vos questions, réponses, commentaires ou suggestions - Les sujets seront ultérieurement répartis dans les archives par les modérateurs

Modérateur : Groupe des modérateurs

Victoire OLIVIER
Messages : 3
Enregistré le : 12 Mar 2018, 14:03

Installation d'udsAnova sous R

Messagepar Victoire OLIVIER » 12 Mar 2018, 22:11

Bonsoir,

Tout d'abord, n'ayant aucune expérience dans l'utilisation d'un forum, je vous prie de m'excuser si ce topic n'apparait pas au bon endroit.

J'ai besoin d'aide pour l'installation du package udsAnova. En effet, je n'arrive pas à l'installer. Mon ordinateur portable est un Mac (macOS Sierra, version 10.12.6). Ma version de R est la suivante R 3.4.3 GUI 1.70 El Capitan build (7463).

Je commence ainsi :

]Packages et données -> installateur de packages -> Package Binaire Local -> Installer (j'ouvre le fichier udsAnova_2.20.zip)


le package ‘udsAnova’ a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés


J'inscris la commande suivante : library (udsAnova) et je choisis Secure CRAN mirror France Lyon 2.

> library(udsAnova)
Le chargement a nécessité le package : tcltk
Le chargement a nécessité le package : tcltk2
Le chargement a nécessité le package : car
Le chargement a nécessité le package : ggplot2
Le chargement a nécessité le package : relimp
Le chargement a nécessité le package : xlsx
Le chargement a nécessité le package : rJava
Error: package or namespace load failed for ‘rJava’:
.onLoad a échoué dans loadNamespace() pour 'rJava', détails :
appel : dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
erreur : impossible de charger l'objet partagé '/Users/victoireolivier/Library/R/3.4/library/rJava/libs/rJava.so':
dlopen(/Users/victoireolivier/Library/R/3.4/library/rJava/libs/rJava.so, 6): Library not loaded: @rpath/libjvm.dylib
Referenced from: /Users/victoireolivier/Library/R/3.4/library/rJava/libs/rJava.so
Reason: image not found
Failed with error: ‘le package ‘rJava’ ne peut être chargé’
De plus : Warning message:
l'exécution de la commande '/usr/libexec/java_home' renvoie un statut 1
--- Please select a CRAN mirror for use in this session ---
Unable to find any JVMs matching version "(null)".
No Java runtime present, try --request to install.
essai de l'URL 'https://mirror.ibcp.fr/pub/CRAN/bin/macosx/el-capitan/contrib/3.4/xlsx_0.5.7.tgz'
Content type 'application/x-gzip' length 401263 bytes (391 KB)
==================================================
downloaded 391 KB


The downloaded binary packages are in
/var/folders/2l/cyc0zw0d763f4prz7786zwfr0000gr/T//RtmpbKPGMy/downloaded_packages
[1] "xlsx"
Le chargement a nécessité le package : lmtest
Le chargement a nécessité le package : zoo

Attachement du package : ‘zoo’

The following objects are masked from ‘package:base’:

as.Date, as.Date.numeric

Le chargement a nécessité le package : nortest
----------------------------------------
GUI for ANOVA 2.31.1
aide dÈtaillÈe avec la commande udsHelp()
----------------------------------------


Aide : votre version est ‡ jour
UdsAnova : votre version UdsAnova est ‡ Jour
Pour charger et accÈder au manuel (en franÁais) : udsHelp()
Pour commencer . . . . . . . . . . . . . . . . : udsAnov()


J'essaie alors d'ouvir udsAnova en appliquant la formule suivante : udsAnov()

> udsAnov()
Loading required package: xlsx
Loading required package: rJava
Error: package or namespace load failed for ‘rJava’:
.onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
error: impossible de charger l'objet partagé '/Users/victoireolivier/Library/R/3.4/library/rJava/libs/rJava.so':
dlopen(/Users/victoireolivier/Library/R/3.4/library/rJava/libs/rJava.so, 6): Library not loaded: @rpath/libjvm.dylib
Referenced from: /Users/victoireolivier/Library/R/3.4/library/rJava/libs/rJava.so
Reason: image not found
Failed with error: ‘package ‘rJava’ could not be loaded’
Unable to find any JVMs matching version "(null)".
No Java runtime present, try --request to install.
essai de l'URL 'https://mirror.ibcp.fr/pub/CRAN/bin/macosx/el-capitan/contrib/3.4/xlsx_0.5.7.tgz'
Content type 'application/x-gzip' length 401263 bytes (391 KB)
==================================================
downloaded 391 KB


The downloaded binary packages are in
/var/folders/2l/cyc0zw0d763f4prz7786zwfr0000gr/T//RtmpbKPGMy/downloaded_packages
[1] "xlsx"
Error in parse(text = cmd) :
caractères multioctets incorrects dans l'analyse de code (parser) à la ligne 1
>


À la suite de cette manipulation, une nouvelle fenêtre s'ouvre grâce à XQuartz (2.7.11 (xorg-server 1.18.4)) mais elle est toute petite et vide (un carré de 5 cm de côté pour être précise…). Donc, ce n'est toujours pas la bonne fenêtre d'udsAnova.

Je tente alors autre chose. Il me semble qu'il y a un problème avec quelque chose qui se nomme " rJava ". Ne sachant pas vraiment ce que ça signifiait, j'ai donc bidouillé (hé… oui…) mais le résultat n'est pas très concluant (c'est pourquoi je vous écris !).

Est-ce que vous pourriez me guider afin de faire fonctionner udsAnova sur un Mac ? Je vous en remercie par avance.

Bonne soirée !

Victoire O.

Mickael Canouil
Messages : 1315
Enregistré le : 04 Avr 2011, 08:53
Contact :

Re: Installation d'udsAnova sous R

Messagepar Mickael Canouil » 14 Mar 2018, 14:00

Bonjour,

vous devez installer les librairies "Java Runtime Environment" (comme l'indique le message "No Java runtime present, try --request to install."), ce qui vous permettra d'installer le package "rJava", qui lui même permettra d'installer "xlsx" et par la suite votre package.

Cordialement,
Mickaël
mickael.canouil.fr | rlille.fr

Victoire OLIVIER
Messages : 3
Enregistré le : 12 Mar 2018, 14:03

Re: Installation d'udsAnova sous R

Messagepar Victoire OLIVIER » 15 Mar 2018, 20:29

Bonsoir,

Tout d'abord, merci pour votre réponse !

Mais, je dois dire que " Java Runtime Environment " ne me parle pas beaucoup plus.

Comment puis-je l'installer ? Par quel biais ?

Cordialement,

Victoire O.

Serge Rapenne
Messages : 1426
Enregistré le : 20 Aoû 2007, 15:17
Contact :

Re: Installation d'udsAnova sous R

Messagepar Serge Rapenne » 16 Mar 2018, 00:25


Victoire OLIVIER
Messages : 3
Enregistré le : 12 Mar 2018, 14:03

Re: Installation d'udsAnova sous R

Messagepar Victoire OLIVIER » 16 Mar 2018, 14:37

Bonjour,

Merci pour votre réponse.

J'ai installé Java à partir du lien que vous m'avez donné.

Ayant redémarré mon ordinateur et m'étant assurée du fonctionnement de Java sur mon navigateur, de retour sur le logiciel R, j'ai effectué les manipulations suivantes :

> install.packages("rJava")
Installation du package dans ‘/Users/victoireolivier/Library/R/3.4/library’
(car ‘lib’ n'est pas spécifié)
--- SVP sélectionner un miroir CRAN pour cette session ---
essai de l'URL 'https://mirror.ibcp.fr/pub/CRAN/bin/macosx/el-capitan/contrib/3.4/rJava_0.9-9.tgz'
Content type 'application/x-gzip' length 626627 bytes (611 KB)
==================================================
downloaded 611 KB


Les packages binaires téléchargés sont dans
/var/folders/2l/cyc0zw0d763f4prz7786zwfr0000gr/T//Rtmp5GQdz6/downloaded_packages


Que dois je faire ensuite ? Ou me suis-je trompée ? Sachant, que j'ai toujours le même message qui s'affiche quand je veux démarrer udsAnova à partir d'un fichier .zip.


Retourner vers « Questions en cours »

Qui est en ligne

Utilisateurs parcourant ce forum : Aucun utilisateur enregistré et 1 invité