Traiter un échantillon à haute variabilité

Postez ici vos questions, réponses, commentaires ou suggestions - Les sujets seront ultérieurement répartis dans les archives par les modérateurs

Modérateur : Groupe des modérateurs

Clara Lefèvre
Messages : 4
Enregistré le : 22 Juin 2018, 06:56

Traiter un échantillon à haute variabilité

Messagepar Clara Lefèvre » 27 Juin 2018, 09:37

Bonjour,

Je teste des valeurs de NO3 pour différents traitements (No-till, monoculture sous couvert, 2 types de rotations culturales sous couvert).
J'ai un design en blocs complets randomisés, avec 4 traitements répétés chacun 3 fois (3 blocs), et pour chaque bloc, 3 réplicats internes(Points).
Je suis bloquée sur l'étude NO3 car pour l'un des traitements (4a), les valeurs sont très variables. Nous l'expliquons par l'influence du couvert végétal présent au moment de l’échantillonnage. Par conséquent, je ne souhaite pas considérer ces valeurs comme outliers.

Ma répartition est la suivante :

Bloc Treatment Point Soil nutrients N-NO3 en mg/kg
1 1 A 0,77
1 1 B 0,65
1 1 C 0,57
1 2 A 0,49
1 2 B 0,32
1 2 C 0,50
1 4a A 4,59
1 4a B 5,15
1 4a C 0,33
1 4b A 5,01
1 4b B 0,23
1 4b C 0,22
2 1 A 0,28
2 1 B NA
2 1 C 0,35
2 2 A 0,70
2 2 B 0,75
2 2 C 0,47
2 4a A 6,71
2 4a B 0,63
2 4a C 0,79
2 4b A 0,46
2 4b B 0,05
2 4b C 0,08
3 1 A 0,49
3 1 B 0,42
3 1 C 0,40
3 2 A 0,47
3 2 B 0,25
3 2 C 0,35
3 4a A 0,43
3 4a B 0,80
3 4a C 4,38
3 4b A 11,48
3 4b B 0,12
3 4b C 1,08

J'ai effectué un modèle mixte généralisé prenant en compte la différence de variabilité entre interne (point) et entre blocs(lmm1 <-lmer(NO3 ~ Treatment+(1|Block/Subplot),data=tab, REML=FALSE)), mais, de manière prévisible je n'ai pas de normalité des résidus. J'ai tenté des modifications de données (passage en log, exp), mais je n'arrive pas à récupérer la normalité. Je ne peux donc pas effectuer mes comparaisons de traitements.

Je me demande donc s'il n'existe pas un autre modèle qui pourrait convenir et me permettre ensuite d'effectuer un test paramétrique..?
Je suis preneuse de vos suggestions...

D'avance merci,
Clara Lefèvre

Serge Rapenne
Messages : 1426
Enregistré le : 20 Aoû 2007, 15:17
Contact :

Re: Traiter un échantillon à haute variabilité

Messagepar Serge Rapenne » 27 Juin 2018, 09:42

Bonjour,

Cette question est une question de statistiques et non une question sur R et son utilisation, elle est donc hors charte.

Serge


Retourner vers « Questions en cours »

Qui est en ligne

Utilisateurs parcourant ce forum : Google [Bot] et 1 invité