moyenne de fichiers netcdf qui n'ont pas la même structure

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Laure Trudel
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moyenne de fichiers netcdf qui n'ont pas la même structure

Messagepar Laure Trudel » 28 Fév 2019, 19:07

Bonjour,

J'ai plusieurs fichiers netcdf de SST dont je voudrais faire la moyenne. J'avais trouvé comment faire mais j'ai du télécharger de nouveaux fichiers qui ne viennent pas du même produit et qui n'ont pas la même structure. J'ai des fichiers à 8 variables et d'autres à 3. Je voudrais savoir si c'est possible de sélectionner uniquement les 3 variables des les fichiers à 8 pour pouvoir ensuite les assembler ?

"3 variables (excluding dimension variables):
int time_bounds[nv,time]
short analysed_sst[lon,lat,time]
long_name: median SST from GMPE
standard_name: sea_surface_temperature
units: kelvin [...]

"8 variables (excluding dimension variables):
float time_bnds[bnds,time]
comment: Contains the start and end times for the time period the data represent
long_name: Time cell boundaries
units: seconds since 1981-01-01 00:00:00" [...]

mon script simplifié c'est:

l <- list.files(pattern = "nc", full.names = TRUE)
l
sst <- raster::stack(l, varname = "analysed_sst")
sst
Error in compareRaster(x) : different number or columns
sst_mean <- calc(sst, mean)
plot(sst_mean)

Merci

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