Merci à Caroline Rondel d'avoir identifié et signalé ce lien où on trouvera, entre autres choses, la manière de faire des anova de type III comme avec SAS (chapitre sur la régression linéaire):
http://didemnid.ucdavis.edu/rtutorial.html
S vous êtes tenté d'utiliser les anova de type III, lisez d'abord ce texte de WN Venables: http://www.stats.ox.ac.uk/pub/MASS3/Exegeses.pdf