rgdal package - problème installation

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Laure Trudel
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rgdal package - problème installation

Messagepar Laure Trudel » 08 Mar 2019, 20:11

Je rencontre un problème pour installer le package rgdal alors que j'utilise R sur le terminal d'un serveur.
J'utilise windows .

install.packages('rgdal')

voilà ce que j'obtiens:

downloaded 1.6 MB

* installing *source* package ‘rgdal’ ...
** package ‘rgdal’ successfully unpacked and MD5 sums checked
configure: R_HOME: /usr/lib64/R
configure: CC: gcc -m64 -std=gnu99
configure: CXX: g++ -m64
configure: C++11 support available
configure: rgdal: 1.3-9
checking for /usr/bin/svnversion... yes
configure: svn revision: 794
checking for gdal-config... no
no
configure: error: gdal-config not found or not executable.
ERROR: configuration failed for package ‘rgdal’
* removing ‘/.autofs/home/ltlod/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.5/rgdal’

The downloaded source packages are in
‘/tmp/RtmpVIpx8n/downloaded_packages’
Warning message:
In install.packages("rgdal") :
installation of package ‘rgdal’ had non-zero exit status

Je comprends qu'il ne trouve pas gdal-config.

Merci,

Serge Rapenne
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Re: rgdal package - problème installation

Messagepar Serge Rapenne » 09 Mar 2019, 12:47

Bonjour,

au vu des messages, il semble que tu veuilles installer rgdal sur un linux-redhat.
Pour que l'installation de rgdal soit possible, il faut au préalable installer dans linux en non dans R les paquets suivants : gdal-devel, proj, proj-nad et proj-epsg. Je n'utilise pas redhat, mais il me semble que :
yum install gdal gdal-devel
yum install proj
yum install proj-nad
yum install proj-epsg

devrait faire l'affaire.

Serge

Laure Trudel
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Re: rgdal package - problème installation

Messagepar Laure Trudel » 09 Mar 2019, 19:10

Bonjour,

J'ai vu ces commandes sur d'autres forums mais je n'ai pas linux j'ai windows donc je ne peux pas installer ça ?
Faut-il que ce soit les informaticiens responsable du serveur qui le fasse ?

Merci

Laure Trudel
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Re: rgdal package - problème installation

Messagepar Laure Trudel » 09 Mar 2019, 19:11

quand je fait la commande :
yum install gdal gdal-devel
j'ai ça comme message

-bash-4.2$ yum install gdal gdal-devel
Loaded plugins: fastestmirror, langpacks, remove-with-leaves
You need to be root to perform this command.

Serge Rapenne
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Re: rgdal package - problème installation

Messagepar Serge Rapenne » 10 Mar 2019, 12:46

Faut-il que ce soit les informaticiens responsable du serveur qui le fasse ?

oui, il faut un compte "administrateur" pour pouvoir lancer les commandes, sur linux le compte administrateur est le compte "root" c'est ce qu'indique le message :
You need to be root to perform this command.

Serge

Laure Trudel
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Re: rgdal package - problème installation

Messagepar Laure Trudel » 10 Mar 2019, 15:30

merci pour votre réponse ça confirme ce que je pensais .

Laure Trudel
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Re: rgdal package - problème installation

Messagepar Laure Trudel » 11 Mar 2019, 19:49

Je confirme que dans mon cas certains packages devaient être installés depuis l'administrateur. Le problème a été résolu en demandant aux administrateurs d'installer rgdal.


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